Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM83

Calm4, Calmodulin-4, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calm4Q9JM83 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Calm4Q9JM83 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Calm4Q9JM83 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Calm4Q9JM83 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Calm4Q9JM83 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Calm4Q9JM83 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Calm4Q9JM83 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Calm4Q9JM83 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Calm4Q9JM83 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Calm4Q9JM83 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Calm4Q9JM83 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Calm4Q9JM83 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Calm4Q9JM83 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Calm4Q9JM83 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Calm4Q9JM83 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calm4Q9JM83 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calm4Q9JM83 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calm4Q9JM83 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calm4Q9JM83 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calm4Q9JM83 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calm4Q9JM83 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calm4Q9JM83 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calm4Q9JM83 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calm4Q9JM83 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calm4Q9JM83 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calm4Q9JM83 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calm4Q9JM83 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calm4Q9JM83 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calm4Q9JM83 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calm4Q9JM83 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calm4Q9JM83 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calm4Q9JM83 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Calm4Q9JM83 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Calm4Q9JM83 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Calm4Q9JM83 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Calm4Q9JM83 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Calm4Q9JM83 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Calm4Q9JM83 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Calm4Q9JM83 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Calm4Q9JM83 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Calm4Q9JM83 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Calm4Q9JM83 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Calm4Q9JM83 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Calm4Q9JM83 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Calm4Q9JM83 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Calm4Q9JM83 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Calm4Q9JM83 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Calm4Q9JM83 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Calm4Q9JM83 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Calm4Q9JM83 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Calm4Q9JM83 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Calm4Q9JM83 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Calm4Q9JM83 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Calm4Q9JM83 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Calm4Q9JM83 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Calm4Q9JM83 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Calm4Q9JM83 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Calm4Q9JM83 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Calm4Q9JM83 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Calm4Q9JM83 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Calm4Q9JM83 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Calm4Q9JM83 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Calm4Q9JM83 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Calm4Q9JM83 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Calm4Q9JM83 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Calm4Q9JM83 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Calm4Q9JM83 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Calm4Q9JM83 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Calm4Q9JM83 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Calm4Q9JM83 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Calm4Q9JM83 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Calm4Q9JM83 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Calm4Q9JM83 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Calm4Q9JM83 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Calm4Q9JM83 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Calm4Q9JM83 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Calm4Q9JM83 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Calm4Q9JM83 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Calm4Q9JM83 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Calm4Q9JM83 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Calm4Q9JM83 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Calm4Q9JM83 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Calm4Q9JM83 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Calm4Q9JM83 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Calm4Q9JM83 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Calm4Q9JM83 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Calm4Q9JM83 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Calm4Q9JM83 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Calm4Q9JM83 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Calm4Q9JM83 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Calm4Q9JM83 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Calm4Q9JM83 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Calm4Q9JM83 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Calm4Q9JM83 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Calm4Q9JM83 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Calm4Q9JM83 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Calm4Q9JM83 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Calm4Q9JM83 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Calm4Q9JM83 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Calm4Q9JM83 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms