Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIF7

Copb1, Coatomer subunit beta, mousemouse

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Length 953 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb1Q9JIF7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Copb1Q9JIF7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Copb1Q9JIF7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Copb1Q9JIF7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Copb1Q9JIF7 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Copb1Q9JIF7 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Copb1Q9JIF7 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Copb1Q9JIF7 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Copb1Q9JIF7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Copb1Q9JIF7 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Copb1Q9JIF7 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Copb1Q9JIF7 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Copb1Q9JIF7 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Copb1Q9JIF7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Copb1Q9JIF7 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Copb1Q9JIF7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Copb1Q9JIF7 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Copb1Q9JIF7 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Copb1Q9JIF7 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Copb1Q9JIF7 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Copb1Q9JIF7 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Copb1Q9JIF7 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Copb1Q9JIF7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Copb1Q9JIF7 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Copb1Q9JIF7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Copb1Q9JIF7 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Copb1Q9JIF7 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Copb1Q9JIF7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Copb1Q9JIF7 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Copb1Q9JIF7 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Copb1Q9JIF7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Copb1Q9JIF7 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Copb1Q9JIF7 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Copb1Q9JIF7 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Copb1Q9JIF7 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Copb1Q9JIF7 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Copb1Q9JIF7 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Copb1Q9JIF7 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Copb1Q9JIF7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Copb1Q9JIF7 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Copb1Q9JIF7 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Copb1Q9JIF7 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Copb1Q9JIF7 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Copb1Q9JIF7 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Copb1Q9JIF7 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Copb1Q9JIF7 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Copb1Q9JIF7 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Copb1Q9JIF7 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Copb1Q9JIF7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Copb1Q9JIF7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Copb1Q9JIF7 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Copb1Q9JIF7 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Copb1Q9JIF7 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Copb1Q9JIF7 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Copb1Q9JIF7 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Copb1Q9JIF7 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Copb1Q9JIF7 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Copb1Q9JIF7 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Copb1Q9JIF7 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Copb1Q9JIF7 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Copb1Q9JIF7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Copb1Q9JIF7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Copb1Q9JIF7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Copb1Q9JIF7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Copb1Q9JIF7 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Copb1Q9JIF7 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Copb1Q9JIF7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Copb1Q9JIF7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Copb1Q9JIF7 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Copb1Q9JIF7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Copb1Q9JIF7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Copb1Q9JIF7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Copb1Q9JIF7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Copb1Q9JIF7 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Copb1Q9JIF7 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Copb1Q9JIF7 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Copb1Q9JIF7 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Copb1Q9JIF7 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Copb1Q9JIF7 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Copb1Q9JIF7 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Copb1Q9JIF7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Copb1Q9JIF7 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Copb1Q9JIF7 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Copb1Q9JIF7 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Copb1Q9JIF7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Copb1Q9JIF7 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Copb1Q9JIF7 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Copb1Q9JIF7 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Copb1Q9JIF7 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Copb1Q9JIF7 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Copb1Q9JIF7 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Copb1Q9JIF7 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Copb1Q9JIF7 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Copb1Q9JIF7 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Copb1Q9JIF7 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Copb1Q9JIF7 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Copb1Q9JIF7 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Copb1Q9JIF7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Copb1Q9JIF7 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Copb1Q9JIF7 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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