Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W8

SMG9, Protein SMG9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG9Q9H0W8 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMG9Q9H0W8 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMG9Q9H0W8 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMG9Q9H0W8 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMG9Q9H0W8 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMG9Q9H0W8 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMG9Q9H0W8 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMG9Q9H0W8 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMG9Q9H0W8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMG9Q9H0W8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMG9Q9H0W8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMG9Q9H0W8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMG9Q9H0W8 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMG9Q9H0W8 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMG9Q9H0W8 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMG9Q9H0W8 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMG9Q9H0W8 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMG9Q9H0W8 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMG9Q9H0W8 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMG9Q9H0W8 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SMG9Q9H0W8 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMG9Q9H0W8 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMG9Q9H0W8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMG9Q9H0W8 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMG9Q9H0W8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMG9Q9H0W8 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SMG9Q9H0W8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMG9Q9H0W8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMG9Q9H0W8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMG9Q9H0W8 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMG9Q9H0W8 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMG9Q9H0W8 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMG9Q9H0W8 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SMG9Q9H0W8 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMG9Q9H0W8 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SMG9Q9H0W8 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SMG9Q9H0W8 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SMG9Q9H0W8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMG9Q9H0W8 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMG9Q9H0W8 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMG9Q9H0W8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMG9Q9H0W8 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMG9Q9H0W8 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMG9Q9H0W8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMG9Q9H0W8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMG9Q9H0W8 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMG9Q9H0W8 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMG9Q9H0W8 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMG9Q9H0W8 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMG9Q9H0W8 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMG9Q9H0W8 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMG9Q9H0W8 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMG9Q9H0W8 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMG9Q9H0W8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMG9Q9H0W8 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMG9Q9H0W8 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SMG9Q9H0W8 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMG9Q9H0W8 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMG9Q9H0W8 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMG9Q9H0W8 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMG9Q9H0W8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMG9Q9H0W8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMG9Q9H0W8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMG9Q9H0W8 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMG9Q9H0W8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMG9Q9H0W8 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMG9Q9H0W8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMG9Q9H0W8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SMG9Q9H0W8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SMG9Q9H0W8 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SMG9Q9H0W8 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SMG9Q9H0W8 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SMG9Q9H0W8 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMG9Q9H0W8 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMG9Q9H0W8 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMG9Q9H0W8 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SMG9Q9H0W8 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMG9Q9H0W8 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMG9Q9H0W8 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMG9Q9H0W8 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMG9Q9H0W8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMG9Q9H0W8 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMG9Q9H0W8 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMG9Q9H0W8 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMG9Q9H0W8 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMG9Q9H0W8 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMG9Q9H0W8 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMG9Q9H0W8 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMG9Q9H0W8 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMG9Q9H0W8 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMG9Q9H0W8 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMG9Q9H0W8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMG9Q9H0W8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMG9Q9H0W8 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMG9Q9H0W8 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMG9Q9H0W8 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMG9Q9H0W8 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMG9Q9H0W8 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMG9Q9H0W8 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMG9Q9H0W8 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
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