Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESM3

Hapln2, Hyaluronan and proteoglycan link protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hapln2Q9ESM3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hapln2Q9ESM3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hapln2Q9ESM3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hapln2Q9ESM3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hapln2Q9ESM3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hapln2Q9ESM3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hapln2Q9ESM3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hapln2Q9ESM3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hapln2Q9ESM3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hapln2Q9ESM3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hapln2Q9ESM3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hapln2Q9ESM3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hapln2Q9ESM3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hapln2Q9ESM3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hapln2Q9ESM3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hapln2Q9ESM3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hapln2Q9ESM3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Hapln2Q9ESM3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hapln2Q9ESM3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hapln2Q9ESM3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hapln2Q9ESM3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hapln2Q9ESM3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hapln2Q9ESM3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hapln2Q9ESM3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hapln2Q9ESM3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hapln2Q9ESM3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hapln2Q9ESM3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hapln2Q9ESM3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hapln2Q9ESM3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Hapln2Q9ESM3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hapln2Q9ESM3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hapln2Q9ESM3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hapln2Q9ESM3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hapln2Q9ESM3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hapln2Q9ESM3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hapln2Q9ESM3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hapln2Q9ESM3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hapln2Q9ESM3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hapln2Q9ESM3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hapln2Q9ESM3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hapln2Q9ESM3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hapln2Q9ESM3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hapln2Q9ESM3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Hapln2Q9ESM3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hapln2Q9ESM3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hapln2Q9ESM3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hapln2Q9ESM3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hapln2Q9ESM3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hapln2Q9ESM3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hapln2Q9ESM3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hapln2Q9ESM3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hapln2Q9ESM3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hapln2Q9ESM3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hapln2Q9ESM3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hapln2Q9ESM3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hapln2Q9ESM3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hapln2Q9ESM3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hapln2Q9ESM3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hapln2Q9ESM3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hapln2Q9ESM3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hapln2Q9ESM3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hapln2Q9ESM3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hapln2Q9ESM3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hapln2Q9ESM3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hapln2Q9ESM3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hapln2Q9ESM3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hapln2Q9ESM3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hapln2Q9ESM3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Hapln2Q9ESM3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hapln2Q9ESM3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hapln2Q9ESM3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hapln2Q9ESM3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hapln2Q9ESM3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hapln2Q9ESM3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hapln2Q9ESM3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hapln2Q9ESM3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hapln2Q9ESM3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hapln2Q9ESM3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hapln2Q9ESM3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hapln2Q9ESM3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hapln2Q9ESM3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hapln2Q9ESM3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Hapln2Q9ESM3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Hapln2Q9ESM3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hapln2Q9ESM3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hapln2Q9ESM3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hapln2Q9ESM3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hapln2Q9ESM3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hapln2Q9ESM3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hapln2Q9ESM3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hapln2Q9ESM3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Hapln2Q9ESM3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hapln2Q9ESM3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hapln2Q9ESM3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hapln2Q9ESM3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hapln2Q9ESM3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hapln2Q9ESM3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hapln2Q9ESM3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hapln2Q9ESM3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hapln2Q9ESM3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms