Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCR2

Ap3s1, AP-3 complex subunit sigma-1, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3s1Q9DCR2 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ap3s1Q9DCR2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ap3s1Q9DCR2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ap3s1Q9DCR2 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ap3s1Q9DCR2 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ap3s1Q9DCR2 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ap3s1Q9DCR2 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ap3s1Q9DCR2 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ap3s1Q9DCR2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ap3s1Q9DCR2 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ap3s1Q9DCR2 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ap3s1Q9DCR2 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ap3s1Q9DCR2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ap3s1Q9DCR2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ap3s1Q9DCR2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ap3s1Q9DCR2 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ap3s1Q9DCR2 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ap3s1Q9DCR2 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ap3s1Q9DCR2 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ap3s1Q9DCR2 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ap3s1Q9DCR2 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ap3s1Q9DCR2 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ap3s1Q9DCR2 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ap3s1Q9DCR2 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ap3s1Q9DCR2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ap3s1Q9DCR2 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ap3s1Q9DCR2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ap3s1Q9DCR2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ap3s1Q9DCR2 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ap3s1Q9DCR2 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ap3s1Q9DCR2 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ap3s1Q9DCR2 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ap3s1Q9DCR2 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ap3s1Q9DCR2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ap3s1Q9DCR2 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ap3s1Q9DCR2 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ap3s1Q9DCR2 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ap3s1Q9DCR2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ap3s1Q9DCR2 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ap3s1Q9DCR2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ap3s1Q9DCR2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ap3s1Q9DCR2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ap3s1Q9DCR2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ap3s1Q9DCR2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ap3s1Q9DCR2 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ap3s1Q9DCR2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ap3s1Q9DCR2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ap3s1Q9DCR2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ap3s1Q9DCR2 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ap3s1Q9DCR2 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ap3s1Q9DCR2 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ap3s1Q9DCR2 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ap3s1Q9DCR2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ap3s1Q9DCR2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ap3s1Q9DCR2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ap3s1Q9DCR2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ap3s1Q9DCR2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ap3s1Q9DCR2 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ap3s1Q9DCR2 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ap3s1Q9DCR2 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ap3s1Q9DCR2 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ap3s1Q9DCR2 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ap3s1Q9DCR2 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ap3s1Q9DCR2 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ap3s1Q9DCR2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ap3s1Q9DCR2 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ap3s1Q9DCR2 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ap3s1Q9DCR2 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ap3s1Q9DCR2 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ap3s1Q9DCR2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ap3s1Q9DCR2 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ap3s1Q9DCR2 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ap3s1Q9DCR2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ap3s1Q9DCR2 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ap3s1Q9DCR2 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ap3s1Q9DCR2 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ap3s1Q9DCR2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ap3s1Q9DCR2 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ap3s1Q9DCR2 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ap3s1Q9DCR2 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ap3s1Q9DCR2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ap3s1Q9DCR2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ap3s1Q9DCR2 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ap3s1Q9DCR2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ap3s1Q9DCR2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ap3s1Q9DCR2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ap3s1Q9DCR2 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ap3s1Q9DCR2 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ap3s1Q9DCR2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ap3s1Q9DCR2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ap3s1Q9DCR2 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ap3s1Q9DCR2 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ap3s1Q9DCR2 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ap3s1Q9DCR2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ap3s1Q9DCR2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ap3s1Q9DCR2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ap3s1Q9DCR2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ap3s1Q9DCR2 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ap3s1Q9DCR2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ap3s1Q9DCR2 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms