Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXC3

Mgme1, Mitochondrial genome maintenance exonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mgme1Q9CXC3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mgme1Q9CXC3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mgme1Q9CXC3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mgme1Q9CXC3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mgme1Q9CXC3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mgme1Q9CXC3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mgme1Q9CXC3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mgme1Q9CXC3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mgme1Q9CXC3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Mgme1Q9CXC3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mgme1Q9CXC3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mgme1Q9CXC3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mgme1Q9CXC3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mgme1Q9CXC3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mgme1Q9CXC3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mgme1Q9CXC3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mgme1Q9CXC3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Mgme1Q9CXC3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mgme1Q9CXC3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mgme1Q9CXC3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mgme1Q9CXC3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mgme1Q9CXC3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mgme1Q9CXC3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mgme1Q9CXC3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mgme1Q9CXC3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mgme1Q9CXC3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mgme1Q9CXC3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mgme1Q9CXC3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mgme1Q9CXC3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mgme1Q9CXC3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mgme1Q9CXC3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mgme1Q9CXC3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mgme1Q9CXC3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mgme1Q9CXC3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mgme1Q9CXC3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mgme1Q9CXC3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mgme1Q9CXC3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Mgme1Q9CXC3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mgme1Q9CXC3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mgme1Q9CXC3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mgme1Q9CXC3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mgme1Q9CXC3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mgme1Q9CXC3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mgme1Q9CXC3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mgme1Q9CXC3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mgme1Q9CXC3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mgme1Q9CXC3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mgme1Q9CXC3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mgme1Q9CXC3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mgme1Q9CXC3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mgme1Q9CXC3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Mgme1Q9CXC3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mgme1Q9CXC3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mgme1Q9CXC3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mgme1Q9CXC3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mgme1Q9CXC3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Mgme1Q9CXC3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Mgme1Q9CXC3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mgme1Q9CXC3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mgme1Q9CXC3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mgme1Q9CXC3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mgme1Q9CXC3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mgme1Q9CXC3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Mgme1Q9CXC3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mgme1Q9CXC3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mgme1Q9CXC3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mgme1Q9CXC3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mgme1Q9CXC3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mgme1Q9CXC3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mgme1Q9CXC3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mgme1Q9CXC3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mgme1Q9CXC3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mgme1Q9CXC3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mgme1Q9CXC3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mgme1Q9CXC3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mgme1Q9CXC3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mgme1Q9CXC3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mgme1Q9CXC3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mgme1Q9CXC3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mgme1Q9CXC3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mgme1Q9CXC3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mgme1Q9CXC3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mgme1Q9CXC3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mgme1Q9CXC3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Mgme1Q9CXC3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mgme1Q9CXC3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mgme1Q9CXC3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mgme1Q9CXC3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mgme1Q9CXC3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mgme1Q9CXC3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mgme1Q9CXC3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mgme1Q9CXC3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mgme1Q9CXC3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mgme1Q9CXC3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mgme1Q9CXC3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mgme1Q9CXC3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mgme1Q9CXC3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mgme1Q9CXC3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mgme1Q9CXC3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mgme1Q9CXC3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms