Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWX1

PHF7, PHD finger protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF7Q9BWX1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHF7Q9BWX1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHF7Q9BWX1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHF7Q9BWX1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHF7Q9BWX1 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHF7Q9BWX1 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHF7Q9BWX1 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHF7Q9BWX1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHF7Q9BWX1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHF7Q9BWX1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHF7Q9BWX1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHF7Q9BWX1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHF7Q9BWX1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHF7Q9BWX1 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHF7Q9BWX1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHF7Q9BWX1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHF7Q9BWX1 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHF7Q9BWX1 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHF7Q9BWX1 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHF7Q9BWX1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHF7Q9BWX1 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHF7Q9BWX1 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHF7Q9BWX1 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHF7Q9BWX1 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PHF7Q9BWX1 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHF7Q9BWX1 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHF7Q9BWX1 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHF7Q9BWX1 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PHF7Q9BWX1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHF7Q9BWX1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHF7Q9BWX1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHF7Q9BWX1 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHF7Q9BWX1 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHF7Q9BWX1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHF7Q9BWX1 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PHF7Q9BWX1 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHF7Q9BWX1 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PHF7Q9BWX1 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHF7Q9BWX1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHF7Q9BWX1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHF7Q9BWX1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHF7Q9BWX1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHF7Q9BWX1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHF7Q9BWX1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHF7Q9BWX1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHF7Q9BWX1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PHF7Q9BWX1 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHF7Q9BWX1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHF7Q9BWX1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHF7Q9BWX1 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHF7Q9BWX1 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHF7Q9BWX1 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHF7Q9BWX1 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PHF7Q9BWX1 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHF7Q9BWX1 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHF7Q9BWX1 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PHF7Q9BWX1 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHF7Q9BWX1 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHF7Q9BWX1 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHF7Q9BWX1 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHF7Q9BWX1 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PHF7Q9BWX1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHF7Q9BWX1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHF7Q9BWX1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHF7Q9BWX1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHF7Q9BWX1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHF7Q9BWX1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHF7Q9BWX1 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHF7Q9BWX1 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHF7Q9BWX1 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHF7Q9BWX1 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHF7Q9BWX1 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHF7Q9BWX1 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHF7Q9BWX1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PHF7Q9BWX1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHF7Q9BWX1 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHF7Q9BWX1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHF7Q9BWX1 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHF7Q9BWX1 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHF7Q9BWX1 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHF7Q9BWX1 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHF7Q9BWX1 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PHF7Q9BWX1 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PHF7Q9BWX1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PHF7Q9BWX1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PHF7Q9BWX1 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PHF7Q9BWX1 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PHF7Q9BWX1 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PHF7Q9BWX1 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PHF7Q9BWX1 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PHF7Q9BWX1 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PHF7Q9BWX1 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PHF7Q9BWX1 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PHF7Q9BWX1 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PHF7Q9BWX1 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PHF7Q9BWX1 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PHF7Q9BWX1 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PHF7Q9BWX1 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PHF7Q9BWX1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PHF7Q9BWX1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms