Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR77

CCDC77, Coiled-coil domain-containing protein 77, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC77Q9BR77 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC77Q9BR77 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC77Q9BR77 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC77Q9BR77 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC77Q9BR77 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC77Q9BR77 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC77Q9BR77 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC77Q9BR77 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC77Q9BR77 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC77Q9BR77 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC77Q9BR77 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC77Q9BR77 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC77Q9BR77 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC77Q9BR77 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC77Q9BR77 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC77Q9BR77 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC77Q9BR77 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC77Q9BR77 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC77Q9BR77 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC77Q9BR77 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC77Q9BR77 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC77Q9BR77 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC77Q9BR77 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC77Q9BR77 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC77Q9BR77 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC77Q9BR77 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC77Q9BR77 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC77Q9BR77 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC77Q9BR77 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC77Q9BR77 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC77Q9BR77 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC77Q9BR77 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC77Q9BR77 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC77Q9BR77 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC77Q9BR77 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC77Q9BR77 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC77Q9BR77 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC77Q9BR77 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC77Q9BR77 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC77Q9BR77 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC77Q9BR77 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC77Q9BR77 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC77Q9BR77 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC77Q9BR77 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC77Q9BR77 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC77Q9BR77 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC77Q9BR77 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC77Q9BR77 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC77Q9BR77 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC77Q9BR77 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC77Q9BR77 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC77Q9BR77 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC77Q9BR77 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC77Q9BR77 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC77Q9BR77 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC77Q9BR77 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC77Q9BR77 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC77Q9BR77 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC77Q9BR77 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC77Q9BR77 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC77Q9BR77 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC77Q9BR77 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC77Q9BR77 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC77Q9BR77 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC77Q9BR77 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC77Q9BR77 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC77Q9BR77 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC77Q9BR77 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC77Q9BR77 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC77Q9BR77 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC77Q9BR77 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC77Q9BR77 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC77Q9BR77 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC77Q9BR77 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC77Q9BR77 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC77Q9BR77 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC77Q9BR77 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC77Q9BR77 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC77Q9BR77 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC77Q9BR77 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC77Q9BR77 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC77Q9BR77 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC77Q9BR77 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC77Q9BR77 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC77Q9BR77 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC77Q9BR77 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC77Q9BR77 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC77Q9BR77 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC77Q9BR77 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC77Q9BR77 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC77Q9BR77 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC77Q9BR77 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC77Q9BR77 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC77Q9BR77 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC77Q9BR77 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC77Q9BR77 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC77Q9BR77 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC77Q9BR77 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC77Q9BR77 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC77Q9BR77 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms