Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP4-12Q9BQ66 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP4-12Q9BQ66 C8orf22-201ENST00000303202 1499 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP4-12Q9BQ66 GLT8D2-202ENST00000546436 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP4-12Q9BQ66 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC00615-201ENST00000546725 1406 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP4-12Q9BQ66 SMN2-214ENST00000626847 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP4-12Q9BQ66 RBMS3-AS2-201ENST00000366321 582 ntTSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP4-12Q9BQ66 RNY3P9-201ENST00000384727 106 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP4-12Q9BQ66 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP4-12Q9BQ66 PTMA-202ENST00000409115 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AC002076.1-201ENST00000435257 527 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AL117382.1-201ENST00000438702 754 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AL049649.1-201ENST00000444792 1105 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR4500HG-204ENST00000453832 827 ntTSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP4-12Q9BQ66 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AC009800.1-201ENST00000511357 1006 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AC107463.1-202ENST00000514526 689 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AC010226.1-203ENST00000515570 765 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AHI1-212ENST00000528103 441 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP4-12Q9BQ66 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AC007298.2-201ENST00000551849 862 ntTSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AC007611.1-202ENST00000564212 854 ntTSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AC017100.1-201ENST00000565978 1169 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF525-206ENST00000593918 590 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AC090772.4-201ENST00000623599 362 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP4-12Q9BQ66 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP4-12Q9BQ66 CASC15-208ENST00000636388 1174 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AC138627.1-204ENST00000641894 765 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP4-12Q9BQ66 MTRNR2L8-201ENST00000536684 1303 ntAPPRIS P1 BASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP4-12Q9BQ66 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP4-12Q9BQ66 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP4-12Q9BQ66 HBG1-201ENST00000330597 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP4-12Q9BQ66 PPIL4-202ENST00000340881 1089 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP4-12Q9BQ66 LGALS14-201ENST00000360675 773 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP4-12Q9BQ66 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC01829-201ENST00000414404 571 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP4-12Q9BQ66 NLGN1-AS1-201ENST00000423873 815 ntTSL 3 BASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AC114402.2-201ENST00000432760 643 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AL031186.1-201ENST00000433125 385 ntTSL 3 BASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP4-12Q9BQ66 LBX1-AS1-202ENST00000434878 418 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AL357060.2-201ENST00000440578 1025 ntTSL 3 BASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AC000124.1-201ENST00000448311 957 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AP001619.2-201ENST00000458654 587 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP4-12Q9BQ66 RPS8P10-201ENST00000460876 622 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP4-12Q9BQ66 RPS3AP6-201ENST00000484430 795 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP4-12Q9BQ66 TRIM36-IT1-201ENST00000503723 881 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AC008840.1-201ENST00000512486 809 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ZCCHC10-210ENST00000513848 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AC022784.5-201ENST00000522241 437 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AC108136.1-201ENST00000530350 631 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP4-12Q9BQ66 EEF1B2P4-201ENST00000551398 348 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP4-12Q9BQ66 C15orf65-201ENST00000569691 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AC005736.3-201ENST00000571169 244 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF235-203ENST00000589248 532 ntTSL 3 BASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF738-203ENST00000594245 1086 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP4-12Q9BQ66 Z94722.1-201ENST00000604328 474 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP4-12Q9BQ66 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AL121895.2-201ENST00000619558 447 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AC135068.6-201ENST00000625294 622 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP4-12Q9BQ66 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP4-12Q9BQ66 CEACAMP3-201ENST00000473762 1548 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP4-12Q9BQ66 DYNC2LI1-201ENST00000260605 1399 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ORC5-203ENST00000447452 1409 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP4-12Q9BQ66 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP4-12Q9BQ66 LIAS-201ENST00000261434 1258 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP4-12Q9BQ66 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP4-12Q9BQ66 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP4-12Q9BQ66 OR6C74-201ENST00000343870 1105 ntAPPRIS P1 BASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP4-12Q9BQ66 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORD116-2-201ENST00000384274 95 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORD116-6-201ENST00000384711 96 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP4-12Q9BQ66 HSPE1-202ENST00000409468 570 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP4-12Q9BQ66 GPC5-AS2-201ENST00000417589 401 ntTSL 3 BASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP4-12Q9BQ66 C5orf58-201ENST00000421269 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC01745-201ENST00000430921 372 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP4-12Q9BQ66 TVP23BP2-201ENST00000455082 615 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AC092953.1-201ENST00000460975 543 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP4-12Q9BQ66 MTCO2P6-201ENST00000463134 685 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP4-12Q9BQ66 UBE2D3-221ENST00000507845 577 ntTSL 4 BASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC10A7-208ENST00000511374 869 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AC131254.2-201ENST00000521908 550 ntTSL 3 BASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AC109466.1-202ENST00000523648 748 ntTSL 3 BASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AP002812.3-201ENST00000527012 551 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AP002495.1-202ENST00000528511 933 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP4-12Q9BQ66 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP4-12Q9BQ66 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AL162171.2-201ENST00000555444 905 ntTSL 3 BASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AC015910.1-202ENST00000580264 633 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AC097504.2-201ENST00000608088 454 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP4-12Q9BQ66 VN1R74P-201ENST00000613259 503 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AC022306.3-201ENST00000619930 550 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AC007494.3-201ENST00000624660 743 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AC000120.1-201ENST00000414227 1589 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP4-12Q9BQ66 PROCR-201ENST00000216968 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP4-12Q9BQ66 LSM8-201ENST00000249299 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP4-12Q9BQ66 RPS20P22-202ENST00000488192 1318 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms