Protein–RNA interactions for Protein: Q96LY2

CCDC74B, Coiled-coil domain-containing protein 74B, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC74BQ96LY2 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC74BQ96LY2 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC74BQ96LY2 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC74BQ96LY2 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC74BQ96LY2 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC74BQ96LY2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC74BQ96LY2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC74BQ96LY2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC74BQ96LY2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC74BQ96LY2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC74BQ96LY2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC74BQ96LY2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC74BQ96LY2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC74BQ96LY2 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC74BQ96LY2 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC74BQ96LY2 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC74BQ96LY2 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC74BQ96LY2 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC74BQ96LY2 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC74BQ96LY2 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC74BQ96LY2 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC74BQ96LY2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC74BQ96LY2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC74BQ96LY2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC74BQ96LY2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC74BQ96LY2 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC74BQ96LY2 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC74BQ96LY2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC74BQ96LY2 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC74BQ96LY2 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC74BQ96LY2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC74BQ96LY2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC74BQ96LY2 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC74BQ96LY2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC74BQ96LY2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC74BQ96LY2 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC74BQ96LY2 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC74BQ96LY2 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC74BQ96LY2 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC74BQ96LY2 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC74BQ96LY2 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC74BQ96LY2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC74BQ96LY2 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC74BQ96LY2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC74BQ96LY2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC74BQ96LY2 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC74BQ96LY2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC74BQ96LY2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC74BQ96LY2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC74BQ96LY2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC74BQ96LY2 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC74BQ96LY2 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC74BQ96LY2 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC74BQ96LY2 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC74BQ96LY2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC74BQ96LY2 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC74BQ96LY2 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC74BQ96LY2 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC74BQ96LY2 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC74BQ96LY2 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC74BQ96LY2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC74BQ96LY2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC74BQ96LY2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC74BQ96LY2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC74BQ96LY2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC74BQ96LY2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC74BQ96LY2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC74BQ96LY2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC74BQ96LY2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC74BQ96LY2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC74BQ96LY2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC74BQ96LY2 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC74BQ96LY2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC74BQ96LY2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC74BQ96LY2 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC74BQ96LY2 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC74BQ96LY2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC74BQ96LY2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC74BQ96LY2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC74BQ96LY2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC74BQ96LY2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC74BQ96LY2 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC74BQ96LY2 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC74BQ96LY2 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC74BQ96LY2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC74BQ96LY2 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC74BQ96LY2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC74BQ96LY2 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC74BQ96LY2 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC74BQ96LY2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC74BQ96LY2 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC74BQ96LY2 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC74BQ96LY2 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC74BQ96LY2 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC74BQ96LY2 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC74BQ96LY2 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC74BQ96LY2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC74BQ96LY2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC74BQ96LY2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC74BQ96LY2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms