Protein–RNA interactions for Protein: Q96FS4

SIPA1, Signal-induced proliferation-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIPA1Q96FS4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIPA1Q96FS4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIPA1Q96FS4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIPA1Q96FS4 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIPA1Q96FS4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIPA1Q96FS4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIPA1Q96FS4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIPA1Q96FS4 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIPA1Q96FS4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIPA1Q96FS4 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIPA1Q96FS4 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIPA1Q96FS4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIPA1Q96FS4 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIPA1Q96FS4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIPA1Q96FS4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIPA1Q96FS4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIPA1Q96FS4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIPA1Q96FS4 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIPA1Q96FS4 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIPA1Q96FS4 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIPA1Q96FS4 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIPA1Q96FS4 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIPA1Q96FS4 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIPA1Q96FS4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIPA1Q96FS4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIPA1Q96FS4 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIPA1Q96FS4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIPA1Q96FS4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
SIPA1Q96FS4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIPA1Q96FS4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIPA1Q96FS4 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIPA1Q96FS4 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SIPA1Q96FS4 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIPA1Q96FS4 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIPA1Q96FS4 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SIPA1Q96FS4 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIPA1Q96FS4 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIPA1Q96FS4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIPA1Q96FS4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIPA1Q96FS4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SIPA1Q96FS4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIPA1Q96FS4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIPA1Q96FS4 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIPA1Q96FS4 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIPA1Q96FS4 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIPA1Q96FS4 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIPA1Q96FS4 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIPA1Q96FS4 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIPA1Q96FS4 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIPA1Q96FS4 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIPA1Q96FS4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIPA1Q96FS4 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIPA1Q96FS4 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIPA1Q96FS4 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIPA1Q96FS4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIPA1Q96FS4 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIPA1Q96FS4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIPA1Q96FS4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIPA1Q96FS4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIPA1Q96FS4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIPA1Q96FS4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIPA1Q96FS4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIPA1Q96FS4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIPA1Q96FS4 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIPA1Q96FS4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIPA1Q96FS4 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIPA1Q96FS4 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIPA1Q96FS4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIPA1Q96FS4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIPA1Q96FS4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIPA1Q96FS4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIPA1Q96FS4 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIPA1Q96FS4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIPA1Q96FS4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIPA1Q96FS4 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIPA1Q96FS4 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIPA1Q96FS4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIPA1Q96FS4 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIPA1Q96FS4 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIPA1Q96FS4 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIPA1Q96FS4 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIPA1Q96FS4 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIPA1Q96FS4 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIPA1Q96FS4 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIPA1Q96FS4 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIPA1Q96FS4 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIPA1Q96FS4 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIPA1Q96FS4 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIPA1Q96FS4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SIPA1Q96FS4 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIPA1Q96FS4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIPA1Q96FS4 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SIPA1Q96FS4 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIPA1Q96FS4 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SIPA1Q96FS4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIPA1Q96FS4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIPA1Q96FS4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIPA1Q96FS4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIPA1Q96FS4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIPA1Q96FS4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms