Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGF29Q96ES7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGF29Q96ES7 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGF29Q96ES7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGF29Q96ES7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGF29Q96ES7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SGF29Q96ES7 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGF29Q96ES7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGF29Q96ES7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGF29Q96ES7 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGF29Q96ES7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SGF29Q96ES7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGF29Q96ES7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGF29Q96ES7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGF29Q96ES7 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGF29Q96ES7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGF29Q96ES7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGF29Q96ES7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGF29Q96ES7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SGF29Q96ES7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGF29Q96ES7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGF29Q96ES7 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGF29Q96ES7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGF29Q96ES7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGF29Q96ES7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGF29Q96ES7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGF29Q96ES7 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SGF29Q96ES7 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGF29Q96ES7 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGF29Q96ES7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGF29Q96ES7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGF29Q96ES7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGF29Q96ES7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGF29Q96ES7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGF29Q96ES7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGF29Q96ES7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGF29Q96ES7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGF29Q96ES7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGF29Q96ES7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SGF29Q96ES7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGF29Q96ES7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGF29Q96ES7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGF29Q96ES7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SGF29Q96ES7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SGF29Q96ES7 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGF29Q96ES7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGF29Q96ES7 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SGF29Q96ES7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGF29Q96ES7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGF29Q96ES7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGF29Q96ES7 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGF29Q96ES7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGF29Q96ES7 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGF29Q96ES7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGF29Q96ES7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SGF29Q96ES7 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGF29Q96ES7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGF29Q96ES7 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGF29Q96ES7 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGF29Q96ES7 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGF29Q96ES7 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SGF29Q96ES7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGF29Q96ES7 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SGF29Q96ES7 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SGF29Q96ES7 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGF29Q96ES7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGF29Q96ES7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGF29Q96ES7 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGF29Q96ES7 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGF29Q96ES7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGF29Q96ES7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGF29Q96ES7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGF29Q96ES7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGF29Q96ES7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGF29Q96ES7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGF29Q96ES7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGF29Q96ES7 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGF29Q96ES7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGF29Q96ES7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGF29Q96ES7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGF29Q96ES7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGF29Q96ES7 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGF29Q96ES7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGF29Q96ES7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGF29Q96ES7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGF29Q96ES7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGF29Q96ES7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SGF29Q96ES7 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGF29Q96ES7 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGF29Q96ES7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGF29Q96ES7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGF29Q96ES7 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGF29Q96ES7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGF29Q96ES7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGF29Q96ES7 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGF29Q96ES7 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGF29Q96ES7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGF29Q96ES7 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGF29Q96ES7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGF29Q96ES7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms