Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc12Q8K5B8 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc12Q8K5B8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc12Q8K5B8 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc12Q8K5B8 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc12Q8K5B8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc12Q8K5B8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc12Q8K5B8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc12Q8K5B8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc12Q8K5B8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc12Q8K5B8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc12Q8K5B8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc12Q8K5B8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc12Q8K5B8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc12Q8K5B8 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc12Q8K5B8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc12Q8K5B8 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc12Q8K5B8 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc12Q8K5B8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc12Q8K5B8 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc12Q8K5B8 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc12Q8K5B8 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc12Q8K5B8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc12Q8K5B8 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc12Q8K5B8 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc12Q8K5B8 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc12Q8K5B8 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Hoxc12Q8K5B8 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc12Q8K5B8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc12Q8K5B8 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc12Q8K5B8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc12Q8K5B8 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc12Q8K5B8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc12Q8K5B8 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc12Q8K5B8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc12Q8K5B8 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc12Q8K5B8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc12Q8K5B8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc12Q8K5B8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc12Q8K5B8 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc12Q8K5B8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc12Q8K5B8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc12Q8K5B8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc12Q8K5B8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc12Q8K5B8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc12Q8K5B8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc12Q8K5B8 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc12Q8K5B8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc12Q8K5B8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc12Q8K5B8 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc12Q8K5B8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc12Q8K5B8 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc12Q8K5B8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc12Q8K5B8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc12Q8K5B8 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc12Q8K5B8 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc12Q8K5B8 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc12Q8K5B8 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc12Q8K5B8 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc12Q8K5B8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc12Q8K5B8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc12Q8K5B8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc12Q8K5B8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc12Q8K5B8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc12Q8K5B8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc12Q8K5B8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc12Q8K5B8 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc12Q8K5B8 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc12Q8K5B8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc12Q8K5B8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc12Q8K5B8 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc12Q8K5B8 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc12Q8K5B8 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc12Q8K5B8 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc12Q8K5B8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc12Q8K5B8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc12Q8K5B8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc12Q8K5B8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc12Q8K5B8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc12Q8K5B8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc12Q8K5B8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc12Q8K5B8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc12Q8K5B8 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc12Q8K5B8 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc12Q8K5B8 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc12Q8K5B8 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc12Q8K5B8 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc12Q8K5B8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc12Q8K5B8 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc12Q8K5B8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc12Q8K5B8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc12Q8K5B8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc12Q8K5B8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc12Q8K5B8 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc12Q8K5B8 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc12Q8K5B8 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc12Q8K5B8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc12Q8K5B8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc12Q8K5B8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc12Q8K5B8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 334 ms