Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW4

CDKL3, Cyclin-dependent kinase-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL3Q8IVW4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDKL3Q8IVW4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDKL3Q8IVW4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDKL3Q8IVW4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDKL3Q8IVW4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDKL3Q8IVW4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDKL3Q8IVW4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDKL3Q8IVW4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CDKL3Q8IVW4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDKL3Q8IVW4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDKL3Q8IVW4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDKL3Q8IVW4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDKL3Q8IVW4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDKL3Q8IVW4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDKL3Q8IVW4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDKL3Q8IVW4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDKL3Q8IVW4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDKL3Q8IVW4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDKL3Q8IVW4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDKL3Q8IVW4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDKL3Q8IVW4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDKL3Q8IVW4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDKL3Q8IVW4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDKL3Q8IVW4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDKL3Q8IVW4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDKL3Q8IVW4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDKL3Q8IVW4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CDKL3Q8IVW4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDKL3Q8IVW4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDKL3Q8IVW4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDKL3Q8IVW4 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDKL3Q8IVW4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDKL3Q8IVW4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDKL3Q8IVW4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CDKL3Q8IVW4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDKL3Q8IVW4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDKL3Q8IVW4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDKL3Q8IVW4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDKL3Q8IVW4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDKL3Q8IVW4 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDKL3Q8IVW4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDKL3Q8IVW4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDKL3Q8IVW4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDKL3Q8IVW4 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDKL3Q8IVW4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDKL3Q8IVW4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDKL3Q8IVW4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDKL3Q8IVW4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDKL3Q8IVW4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDKL3Q8IVW4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDKL3Q8IVW4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDKL3Q8IVW4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDKL3Q8IVW4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDKL3Q8IVW4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDKL3Q8IVW4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDKL3Q8IVW4 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDKL3Q8IVW4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDKL3Q8IVW4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDKL3Q8IVW4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDKL3Q8IVW4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDKL3Q8IVW4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDKL3Q8IVW4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDKL3Q8IVW4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDKL3Q8IVW4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDKL3Q8IVW4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDKL3Q8IVW4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDKL3Q8IVW4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDKL3Q8IVW4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDKL3Q8IVW4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDKL3Q8IVW4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDKL3Q8IVW4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CDKL3Q8IVW4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CDKL3Q8IVW4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CDKL3Q8IVW4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CDKL3Q8IVW4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDKL3Q8IVW4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDKL3Q8IVW4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDKL3Q8IVW4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDKL3Q8IVW4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDKL3Q8IVW4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDKL3Q8IVW4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDKL3Q8IVW4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDKL3Q8IVW4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDKL3Q8IVW4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDKL3Q8IVW4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CDKL3Q8IVW4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CDKL3Q8IVW4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDKL3Q8IVW4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDKL3Q8IVW4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDKL3Q8IVW4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDKL3Q8IVW4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDKL3Q8IVW4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDKL3Q8IVW4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDKL3Q8IVW4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDKL3Q8IVW4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDKL3Q8IVW4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CDKL3Q8IVW4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDKL3Q8IVW4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDKL3Q8IVW4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CDKL3Q8IVW4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms