Protein–RNA interactions for Protein: Q8BK84

Dupd1, Dual specificity phosphatase DUPD1, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dupd1Q8BK84 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dupd1Q8BK84 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dupd1Q8BK84 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dupd1Q8BK84 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Dupd1Q8BK84 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dupd1Q8BK84 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dupd1Q8BK84 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dupd1Q8BK84 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dupd1Q8BK84 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dupd1Q8BK84 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dupd1Q8BK84 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dupd1Q8BK84 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dupd1Q8BK84 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dupd1Q8BK84 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dupd1Q8BK84 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Dupd1Q8BK84 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dupd1Q8BK84 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dupd1Q8BK84 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Dupd1Q8BK84 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Dupd1Q8BK84 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Dupd1Q8BK84 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Dupd1Q8BK84 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Dupd1Q8BK84 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Dupd1Q8BK84 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Dupd1Q8BK84 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Dupd1Q8BK84 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Dupd1Q8BK84 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Dupd1Q8BK84 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Dupd1Q8BK84 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Dupd1Q8BK84 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Dupd1Q8BK84 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dupd1Q8BK84 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dupd1Q8BK84 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dupd1Q8BK84 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dupd1Q8BK84 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dupd1Q8BK84 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Dupd1Q8BK84 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dupd1Q8BK84 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dupd1Q8BK84 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Dupd1Q8BK84 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dupd1Q8BK84 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dupd1Q8BK84 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dupd1Q8BK84 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dupd1Q8BK84 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dupd1Q8BK84 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dupd1Q8BK84 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dupd1Q8BK84 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dupd1Q8BK84 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dupd1Q8BK84 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Dupd1Q8BK84 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dupd1Q8BK84 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dupd1Q8BK84 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dupd1Q8BK84 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dupd1Q8BK84 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dupd1Q8BK84 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dupd1Q8BK84 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dupd1Q8BK84 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dupd1Q8BK84 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dupd1Q8BK84 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dupd1Q8BK84 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dupd1Q8BK84 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dupd1Q8BK84 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dupd1Q8BK84 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dupd1Q8BK84 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dupd1Q8BK84 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dupd1Q8BK84 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Dupd1Q8BK84 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Dupd1Q8BK84 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Dupd1Q8BK84 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Dupd1Q8BK84 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Dupd1Q8BK84 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dupd1Q8BK84 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dupd1Q8BK84 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dupd1Q8BK84 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dupd1Q8BK84 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dupd1Q8BK84 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dupd1Q8BK84 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dupd1Q8BK84 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dupd1Q8BK84 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dupd1Q8BK84 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dupd1Q8BK84 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dupd1Q8BK84 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dupd1Q8BK84 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Dupd1Q8BK84 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Dupd1Q8BK84 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Dupd1Q8BK84 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Dupd1Q8BK84 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Dupd1Q8BK84 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Dupd1Q8BK84 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dupd1Q8BK84 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Dupd1Q8BK84 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dupd1Q8BK84 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dupd1Q8BK84 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dupd1Q8BK84 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dupd1Q8BK84 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dupd1Q8BK84 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dupd1Q8BK84 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dupd1Q8BK84 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dupd1Q8BK84 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dupd1Q8BK84 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms