Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC84Q86UT8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC84Q86UT8 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC84Q86UT8 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC84Q86UT8 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC84Q86UT8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC84Q86UT8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC84Q86UT8 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC84Q86UT8 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC84Q86UT8 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC84Q86UT8 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC84Q86UT8 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC84Q86UT8 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC84Q86UT8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC84Q86UT8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC84Q86UT8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC84Q86UT8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
CCDC84Q86UT8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC84Q86UT8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC84Q86UT8 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC84Q86UT8 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC84Q86UT8 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC84Q86UT8 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC84Q86UT8 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC84Q86UT8 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC84Q86UT8 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC84Q86UT8 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC84Q86UT8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC84Q86UT8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC84Q86UT8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC84Q86UT8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC84Q86UT8 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC84Q86UT8 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC84Q86UT8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC84Q86UT8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC84Q86UT8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC84Q86UT8 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC84Q86UT8 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC84Q86UT8 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC84Q86UT8 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC84Q86UT8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC84Q86UT8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC84Q86UT8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC84Q86UT8 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC84Q86UT8 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC84Q86UT8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC84Q86UT8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC84Q86UT8 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC84Q86UT8 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC84Q86UT8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC84Q86UT8 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC84Q86UT8 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC84Q86UT8 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC84Q86UT8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC84Q86UT8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC84Q86UT8 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC84Q86UT8 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC84Q86UT8 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC84Q86UT8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC84Q86UT8 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC84Q86UT8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC84Q86UT8 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC84Q86UT8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC84Q86UT8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC84Q86UT8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC84Q86UT8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC84Q86UT8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC84Q86UT8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC84Q86UT8 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC84Q86UT8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC84Q86UT8 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC84Q86UT8 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC84Q86UT8 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC84Q86UT8 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC84Q86UT8 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC84Q86UT8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC84Q86UT8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCDC84Q86UT8 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC84Q86UT8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC84Q86UT8 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC84Q86UT8 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC84Q86UT8 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC84Q86UT8 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC84Q86UT8 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC84Q86UT8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC84Q86UT8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC84Q86UT8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC84Q86UT8 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC84Q86UT8 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC84Q86UT8 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC84Q86UT8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC84Q86UT8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC84Q86UT8 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC84Q86UT8 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC84Q86UT8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC84Q86UT8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC84Q86UT8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC84Q86UT8 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC84Q86UT8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC84Q86UT8 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms