Protein–RNA interactions for Protein: Q810Q5

Nmes1, Normal mucosa of esophagus-specific gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmes1Q810Q5 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nmes1Q810Q5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nmes1Q810Q5 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nmes1Q810Q5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nmes1Q810Q5 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nmes1Q810Q5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nmes1Q810Q5 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nmes1Q810Q5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nmes1Q810Q5 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nmes1Q810Q5 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nmes1Q810Q5 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nmes1Q810Q5 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nmes1Q810Q5 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nmes1Q810Q5 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nmes1Q810Q5 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nmes1Q810Q5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nmes1Q810Q5 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nmes1Q810Q5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nmes1Q810Q5 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nmes1Q810Q5 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nmes1Q810Q5 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nmes1Q810Q5 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nmes1Q810Q5 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nmes1Q810Q5 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nmes1Q810Q5 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nmes1Q810Q5 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nmes1Q810Q5 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nmes1Q810Q5 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nmes1Q810Q5 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nmes1Q810Q5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nmes1Q810Q5 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nmes1Q810Q5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nmes1Q810Q5 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nmes1Q810Q5 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nmes1Q810Q5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nmes1Q810Q5 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nmes1Q810Q5 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nmes1Q810Q5 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nmes1Q810Q5 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nmes1Q810Q5 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nmes1Q810Q5 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nmes1Q810Q5 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nmes1Q810Q5 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nmes1Q810Q5 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nmes1Q810Q5 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nmes1Q810Q5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nmes1Q810Q5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nmes1Q810Q5 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nmes1Q810Q5 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nmes1Q810Q5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nmes1Q810Q5 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nmes1Q810Q5 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nmes1Q810Q5 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nmes1Q810Q5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nmes1Q810Q5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nmes1Q810Q5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nmes1Q810Q5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nmes1Q810Q5 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nmes1Q810Q5 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nmes1Q810Q5 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nmes1Q810Q5 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nmes1Q810Q5 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nmes1Q810Q5 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nmes1Q810Q5 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nmes1Q810Q5 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nmes1Q810Q5 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nmes1Q810Q5 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nmes1Q810Q5 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nmes1Q810Q5 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nmes1Q810Q5 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nmes1Q810Q5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nmes1Q810Q5 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nmes1Q810Q5 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nmes1Q810Q5 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nmes1Q810Q5 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nmes1Q810Q5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nmes1Q810Q5 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nmes1Q810Q5 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nmes1Q810Q5 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nmes1Q810Q5 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nmes1Q810Q5 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nmes1Q810Q5 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nmes1Q810Q5 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nmes1Q810Q5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nmes1Q810Q5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nmes1Q810Q5 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nmes1Q810Q5 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nmes1Q810Q5 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nmes1Q810Q5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nmes1Q810Q5 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nmes1Q810Q5 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nmes1Q810Q5 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nmes1Q810Q5 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nmes1Q810Q5 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nmes1Q810Q5 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nmes1Q810Q5 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nmes1Q810Q5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nmes1Q810Q5 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nmes1Q810Q5 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nmes1Q810Q5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms