Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZBED9Q6R2W3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZBED9Q6R2W3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZBED9Q6R2W3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZBED9Q6R2W3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZBED9Q6R2W3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZBED9Q6R2W3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZBED9Q6R2W3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ZBED9Q6R2W3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ZBED9Q6R2W3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ZBED9Q6R2W3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ZBED9Q6R2W3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ZBED9Q6R2W3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ZBED9Q6R2W3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ZBED9Q6R2W3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ZBED9Q6R2W3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ZBED9Q6R2W3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ZBED9Q6R2W3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ZBED9Q6R2W3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ZBED9Q6R2W3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
ZBED9Q6R2W3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZBED9Q6R2W3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZBED9Q6R2W3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZBED9Q6R2W3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZBED9Q6R2W3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZBED9Q6R2W3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZBED9Q6R2W3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZBED9Q6R2W3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZBED9Q6R2W3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZBED9Q6R2W3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ZBED9Q6R2W3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
ZBED9Q6R2W3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
ZBED9Q6R2W3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
ZBED9Q6R2W3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
ZBED9Q6R2W3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
ZBED9Q6R2W3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
ZBED9Q6R2W3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
ZBED9Q6R2W3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
ZBED9Q6R2W3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ZBED9Q6R2W3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ZBED9Q6R2W3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ZBED9Q6R2W3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ZBED9Q6R2W3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ZBED9Q6R2W3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ZBED9Q6R2W3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ZBED9Q6R2W3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ZBED9Q6R2W3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ZBED9Q6R2W3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ZBED9Q6R2W3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ZBED9Q6R2W3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ZBED9Q6R2W3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ZBED9Q6R2W3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ZBED9Q6R2W3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ZBED9Q6R2W3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ZBED9Q6R2W3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ZBED9Q6R2W3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ZBED9Q6R2W3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ZBED9Q6R2W3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ZBED9Q6R2W3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ZBED9Q6R2W3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ZBED9Q6R2W3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ZBED9Q6R2W3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ZBED9Q6R2W3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ZBED9Q6R2W3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ZBED9Q6R2W3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
ZBED9Q6R2W3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ZBED9Q6R2W3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ZBED9Q6R2W3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ZBED9Q6R2W3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ZBED9Q6R2W3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ZBED9Q6R2W3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ZBED9Q6R2W3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ZBED9Q6R2W3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ZBED9Q6R2W3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ZBED9Q6R2W3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ZBED9Q6R2W3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ZBED9Q6R2W3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ZBED9Q6R2W3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ZBED9Q6R2W3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ZBED9Q6R2W3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
ZBED9Q6R2W3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ZBED9Q6R2W3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ZBED9Q6R2W3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ZBED9Q6R2W3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
ZBED9Q6R2W3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ZBED9Q6R2W3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
ZBED9Q6R2W3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
ZBED9Q6R2W3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
ZBED9Q6R2W3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
ZBED9Q6R2W3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
ZBED9Q6R2W3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZBED9Q6R2W3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZBED9Q6R2W3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZBED9Q6R2W3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZBED9Q6R2W3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZBED9Q6R2W3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZBED9Q6R2W3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZBED9Q6R2W3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZBED9Q6R2W3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
ZBED9Q6R2W3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms