Protein–RNA interactions for Protein: Q6EEV6

SUMO4, Small ubiquitin-related modifier 4, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO4Q6EEV6 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SUMO4Q6EEV6 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SUMO4Q6EEV6 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SUMO4Q6EEV6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUMO4Q6EEV6 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUMO4Q6EEV6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUMO4Q6EEV6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUMO4Q6EEV6 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUMO4Q6EEV6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUMO4Q6EEV6 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUMO4Q6EEV6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUMO4Q6EEV6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUMO4Q6EEV6 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUMO4Q6EEV6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUMO4Q6EEV6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUMO4Q6EEV6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUMO4Q6EEV6 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SUMO4Q6EEV6 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUMO4Q6EEV6 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUMO4Q6EEV6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUMO4Q6EEV6 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUMO4Q6EEV6 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SUMO4Q6EEV6 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUMO4Q6EEV6 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUMO4Q6EEV6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUMO4Q6EEV6 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUMO4Q6EEV6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUMO4Q6EEV6 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUMO4Q6EEV6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUMO4Q6EEV6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUMO4Q6EEV6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUMO4Q6EEV6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUMO4Q6EEV6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUMO4Q6EEV6 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUMO4Q6EEV6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SUMO4Q6EEV6 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUMO4Q6EEV6 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUMO4Q6EEV6 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUMO4Q6EEV6 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUMO4Q6EEV6 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUMO4Q6EEV6 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUMO4Q6EEV6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SUMO4Q6EEV6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUMO4Q6EEV6 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUMO4Q6EEV6 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUMO4Q6EEV6 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUMO4Q6EEV6 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUMO4Q6EEV6 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUMO4Q6EEV6 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUMO4Q6EEV6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUMO4Q6EEV6 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUMO4Q6EEV6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUMO4Q6EEV6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SUMO4Q6EEV6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SUMO4Q6EEV6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUMO4Q6EEV6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SUMO4Q6EEV6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUMO4Q6EEV6 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUMO4Q6EEV6 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUMO4Q6EEV6 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUMO4Q6EEV6 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUMO4Q6EEV6 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUMO4Q6EEV6 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUMO4Q6EEV6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUMO4Q6EEV6 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUMO4Q6EEV6 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUMO4Q6EEV6 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUMO4Q6EEV6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUMO4Q6EEV6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUMO4Q6EEV6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUMO4Q6EEV6 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUMO4Q6EEV6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUMO4Q6EEV6 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUMO4Q6EEV6 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SUMO4Q6EEV6 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SUMO4Q6EEV6 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SUMO4Q6EEV6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SUMO4Q6EEV6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SUMO4Q6EEV6 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SUMO4Q6EEV6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SUMO4Q6EEV6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SUMO4Q6EEV6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SUMO4Q6EEV6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SUMO4Q6EEV6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SUMO4Q6EEV6 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SUMO4Q6EEV6 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SUMO4Q6EEV6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SUMO4Q6EEV6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SUMO4Q6EEV6 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SUMO4Q6EEV6 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SUMO4Q6EEV6 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SUMO4Q6EEV6 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SUMO4Q6EEV6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SUMO4Q6EEV6 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SUMO4Q6EEV6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SUMO4Q6EEV6 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SUMO4Q6EEV6 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SUMO4Q6EEV6 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SUMO4Q6EEV6 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SUMO4Q6EEV6 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms