Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT52

RPRD2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD2Q5VT52 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
RPRD2Q5VT52 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
RPRD2Q5VT52 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
RPRD2Q5VT52 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.81
RPRD2Q5VT52 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.81
RPRD2Q5VT52 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
RPRD2Q5VT52 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
RPRD2Q5VT52 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
RPRD2Q5VT52 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
RPRD2Q5VT52 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
RPRD2Q5VT52 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
RPRD2Q5VT52 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
RPRD2Q5VT52 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
RPRD2Q5VT52 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
RPRD2Q5VT52 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC32.62■■■□□ 2.81
RPRD2Q5VT52 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
RPRD2Q5VT52 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
RPRD2Q5VT52 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
RPRD2Q5VT52 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
RPRD2Q5VT52 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
RPRD2Q5VT52 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
RPRD2Q5VT52 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
RPRD2Q5VT52 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
RPRD2Q5VT52 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
RPRD2Q5VT52 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
RPRD2Q5VT52 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
RPRD2Q5VT52 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
RPRD2Q5VT52 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
RPRD2Q5VT52 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
RPRD2Q5VT52 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
RPRD2Q5VT52 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
RPRD2Q5VT52 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
RPRD2Q5VT52 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
RPRD2Q5VT52 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
RPRD2Q5VT52 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
RPRD2Q5VT52 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
RPRD2Q5VT52 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC32.6■■■□□ 2.81
RPRD2Q5VT52 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
RPRD2Q5VT52 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
RPRD2Q5VT52 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
RPRD2Q5VT52 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
RPRD2Q5VT52 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
RPRD2Q5VT52 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
RPRD2Q5VT52 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
RPRD2Q5VT52 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
RPRD2Q5VT52 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
RPRD2Q5VT52 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
RPRD2Q5VT52 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
RPRD2Q5VT52 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
RPRD2Q5VT52 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
RPRD2Q5VT52 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
RPRD2Q5VT52 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC32.58■■■□□ 2.81
RPRD2Q5VT52 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
RPRD2Q5VT52 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
RPRD2Q5VT52 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
RPRD2Q5VT52 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
RPRD2Q5VT52 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
RPRD2Q5VT52 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
RPRD2Q5VT52 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
RPRD2Q5VT52 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
RPRD2Q5VT52 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
RPRD2Q5VT52 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
RPRD2Q5VT52 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
RPRD2Q5VT52 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
RPRD2Q5VT52 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
RPRD2Q5VT52 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
RPRD2Q5VT52 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
RPRD2Q5VT52 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
RPRD2Q5VT52 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
RPRD2Q5VT52 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
RPRD2Q5VT52 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
RPRD2Q5VT52 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
RPRD2Q5VT52 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
RPRD2Q5VT52 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
RPRD2Q5VT52 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
RPRD2Q5VT52 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
RPRD2Q5VT52 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
RPRD2Q5VT52 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
RPRD2Q5VT52 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
RPRD2Q5VT52 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
RPRD2Q5VT52 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
RPRD2Q5VT52 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
RPRD2Q5VT52 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC32.54■■■□□ 2.8
RPRD2Q5VT52 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
RPRD2Q5VT52 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
RPRD2Q5VT52 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
RPRD2Q5VT52 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
RPRD2Q5VT52 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
RPRD2Q5VT52 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
RPRD2Q5VT52 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
RPRD2Q5VT52 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC32.53■■■□□ 2.8
RPRD2Q5VT52 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
RPRD2Q5VT52 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
RPRD2Q5VT52 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
RPRD2Q5VT52 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
RPRD2Q5VT52 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
RPRD2Q5VT52 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
RPRD2Q5VT52 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
RPRD2Q5VT52 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
RPRD2Q5VT52 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms