Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDE5

SVEP1, Sushi, von Willebrand factor type A, EGF and pentraxin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 3,571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVEP1Q4LDE5 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SVEP1Q4LDE5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SVEP1Q4LDE5 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SVEP1Q4LDE5 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SVEP1Q4LDE5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SVEP1Q4LDE5 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SVEP1Q4LDE5 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SVEP1Q4LDE5 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SVEP1Q4LDE5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SVEP1Q4LDE5 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SVEP1Q4LDE5 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SVEP1Q4LDE5 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SVEP1Q4LDE5 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SVEP1Q4LDE5 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SVEP1Q4LDE5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SVEP1Q4LDE5 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SVEP1Q4LDE5 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SVEP1Q4LDE5 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SVEP1Q4LDE5 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SVEP1Q4LDE5 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SVEP1Q4LDE5 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SVEP1Q4LDE5 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SVEP1Q4LDE5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SVEP1Q4LDE5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SVEP1Q4LDE5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SVEP1Q4LDE5 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SVEP1Q4LDE5 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SVEP1Q4LDE5 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SVEP1Q4LDE5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SVEP1Q4LDE5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SVEP1Q4LDE5 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SVEP1Q4LDE5 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SVEP1Q4LDE5 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SVEP1Q4LDE5 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SVEP1Q4LDE5 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SVEP1Q4LDE5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SVEP1Q4LDE5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SVEP1Q4LDE5 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SVEP1Q4LDE5 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SVEP1Q4LDE5 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SVEP1Q4LDE5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SVEP1Q4LDE5 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SVEP1Q4LDE5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SVEP1Q4LDE5 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SVEP1Q4LDE5 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SVEP1Q4LDE5 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SVEP1Q4LDE5 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SVEP1Q4LDE5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SVEP1Q4LDE5 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SVEP1Q4LDE5 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SVEP1Q4LDE5 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SVEP1Q4LDE5 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SVEP1Q4LDE5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SVEP1Q4LDE5 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SVEP1Q4LDE5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SVEP1Q4LDE5 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SVEP1Q4LDE5 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SVEP1Q4LDE5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SVEP1Q4LDE5 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SVEP1Q4LDE5 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SVEP1Q4LDE5 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SVEP1Q4LDE5 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SVEP1Q4LDE5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SVEP1Q4LDE5 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SVEP1Q4LDE5 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SVEP1Q4LDE5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SVEP1Q4LDE5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SVEP1Q4LDE5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SVEP1Q4LDE5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SVEP1Q4LDE5 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SVEP1Q4LDE5 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SVEP1Q4LDE5 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SVEP1Q4LDE5 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SVEP1Q4LDE5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SVEP1Q4LDE5 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SVEP1Q4LDE5 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SVEP1Q4LDE5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SVEP1Q4LDE5 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SVEP1Q4LDE5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SVEP1Q4LDE5 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SVEP1Q4LDE5 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SVEP1Q4LDE5 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SVEP1Q4LDE5 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SVEP1Q4LDE5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SVEP1Q4LDE5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SVEP1Q4LDE5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SVEP1Q4LDE5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SVEP1Q4LDE5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SVEP1Q4LDE5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SVEP1Q4LDE5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SVEP1Q4LDE5 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SVEP1Q4LDE5 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SVEP1Q4LDE5 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SVEP1Q4LDE5 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SVEP1Q4LDE5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SVEP1Q4LDE5 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SVEP1Q4LDE5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SVEP1Q4LDE5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SVEP1Q4LDE5 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SVEP1Q4LDE5 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms