Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXB0

Mbd3l2, Methyl-CpG-binding domain protein 3-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3l2Q3UXB0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd3l2Q3UXB0 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd3l2Q3UXB0 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd3l2Q3UXB0 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd3l2Q3UXB0 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd3l2Q3UXB0 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd3l2Q3UXB0 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd3l2Q3UXB0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd3l2Q3UXB0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd3l2Q3UXB0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd3l2Q3UXB0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd3l2Q3UXB0 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd3l2Q3UXB0 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd3l2Q3UXB0 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd3l2Q3UXB0 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd3l2Q3UXB0 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd3l2Q3UXB0 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mbd3l2Q3UXB0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mbd3l2Q3UXB0 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mbd3l2Q3UXB0 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mbd3l2Q3UXB0 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mbd3l2Q3UXB0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mbd3l2Q3UXB0 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mbd3l2Q3UXB0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mbd3l2Q3UXB0 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mbd3l2Q3UXB0 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mbd3l2Q3UXB0 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd3l2Q3UXB0 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd3l2Q3UXB0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd3l2Q3UXB0 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd3l2Q3UXB0 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd3l2Q3UXB0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd3l2Q3UXB0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd3l2Q3UXB0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd3l2Q3UXB0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd3l2Q3UXB0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd3l2Q3UXB0 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd3l2Q3UXB0 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd3l2Q3UXB0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd3l2Q3UXB0 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd3l2Q3UXB0 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd3l2Q3UXB0 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd3l2Q3UXB0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd3l2Q3UXB0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd3l2Q3UXB0 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd3l2Q3UXB0 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd3l2Q3UXB0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd3l2Q3UXB0 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd3l2Q3UXB0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd3l2Q3UXB0 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd3l2Q3UXB0 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd3l2Q3UXB0 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd3l2Q3UXB0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd3l2Q3UXB0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd3l2Q3UXB0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd3l2Q3UXB0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd3l2Q3UXB0 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd3l2Q3UXB0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd3l2Q3UXB0 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd3l2Q3UXB0 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd3l2Q3UXB0 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd3l2Q3UXB0 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mbd3l2Q3UXB0 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mbd3l2Q3UXB0 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mbd3l2Q3UXB0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mbd3l2Q3UXB0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mbd3l2Q3UXB0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mbd3l2Q3UXB0 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mbd3l2Q3UXB0 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mbd3l2Q3UXB0 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Mbd3l2Q3UXB0 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mbd3l2Q3UXB0 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mbd3l2Q3UXB0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mbd3l2Q3UXB0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mbd3l2Q3UXB0 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mbd3l2Q3UXB0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mbd3l2Q3UXB0 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mbd3l2Q3UXB0 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Mbd3l2Q3UXB0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mbd3l2Q3UXB0 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mbd3l2Q3UXB0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mbd3l2Q3UXB0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mbd3l2Q3UXB0 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mbd3l2Q3UXB0 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mbd3l2Q3UXB0 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mbd3l2Q3UXB0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mbd3l2Q3UXB0 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mbd3l2Q3UXB0 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mbd3l2Q3UXB0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mbd3l2Q3UXB0 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mbd3l2Q3UXB0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mbd3l2Q3UXB0 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mbd3l2Q3UXB0 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mbd3l2Q3UXB0 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mbd3l2Q3UXB0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mbd3l2Q3UXB0 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mbd3l2Q3UXB0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mbd3l2Q3UXB0 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mbd3l2Q3UXB0 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mbd3l2Q3UXB0 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms