Protein–RNA interactions for Protein: Q3TC93

Hs1bp3, HCLS1-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hs1bp3Q3TC93 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hs1bp3Q3TC93 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hs1bp3Q3TC93 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hs1bp3Q3TC93 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hs1bp3Q3TC93 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hs1bp3Q3TC93 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hs1bp3Q3TC93 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hs1bp3Q3TC93 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hs1bp3Q3TC93 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hs1bp3Q3TC93 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hs1bp3Q3TC93 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Hs1bp3Q3TC93 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Hs1bp3Q3TC93 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hs1bp3Q3TC93 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hs1bp3Q3TC93 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hs1bp3Q3TC93 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hs1bp3Q3TC93 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hs1bp3Q3TC93 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hs1bp3Q3TC93 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hs1bp3Q3TC93 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hs1bp3Q3TC93 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hs1bp3Q3TC93 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hs1bp3Q3TC93 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Hs1bp3Q3TC93 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hs1bp3Q3TC93 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hs1bp3Q3TC93 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hs1bp3Q3TC93 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hs1bp3Q3TC93 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hs1bp3Q3TC93 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hs1bp3Q3TC93 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hs1bp3Q3TC93 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hs1bp3Q3TC93 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hs1bp3Q3TC93 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hs1bp3Q3TC93 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hs1bp3Q3TC93 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hs1bp3Q3TC93 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hs1bp3Q3TC93 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hs1bp3Q3TC93 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hs1bp3Q3TC93 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hs1bp3Q3TC93 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hs1bp3Q3TC93 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hs1bp3Q3TC93 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hs1bp3Q3TC93 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hs1bp3Q3TC93 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hs1bp3Q3TC93 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Hs1bp3Q3TC93 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Hs1bp3Q3TC93 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hs1bp3Q3TC93 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hs1bp3Q3TC93 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hs1bp3Q3TC93 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hs1bp3Q3TC93 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hs1bp3Q3TC93 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hs1bp3Q3TC93 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hs1bp3Q3TC93 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Hs1bp3Q3TC93 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hs1bp3Q3TC93 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hs1bp3Q3TC93 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hs1bp3Q3TC93 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hs1bp3Q3TC93 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hs1bp3Q3TC93 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hs1bp3Q3TC93 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hs1bp3Q3TC93 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hs1bp3Q3TC93 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hs1bp3Q3TC93 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Hs1bp3Q3TC93 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hs1bp3Q3TC93 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hs1bp3Q3TC93 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hs1bp3Q3TC93 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hs1bp3Q3TC93 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hs1bp3Q3TC93 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hs1bp3Q3TC93 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hs1bp3Q3TC93 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hs1bp3Q3TC93 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hs1bp3Q3TC93 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hs1bp3Q3TC93 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hs1bp3Q3TC93 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hs1bp3Q3TC93 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hs1bp3Q3TC93 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hs1bp3Q3TC93 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hs1bp3Q3TC93 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hs1bp3Q3TC93 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hs1bp3Q3TC93 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Hs1bp3Q3TC93 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Hs1bp3Q3TC93 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hs1bp3Q3TC93 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hs1bp3Q3TC93 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hs1bp3Q3TC93 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hs1bp3Q3TC93 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hs1bp3Q3TC93 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hs1bp3Q3TC93 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hs1bp3Q3TC93 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hs1bp3Q3TC93 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hs1bp3Q3TC93 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hs1bp3Q3TC93 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hs1bp3Q3TC93 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hs1bp3Q3TC93 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hs1bp3Q3TC93 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hs1bp3Q3TC93 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hs1bp3Q3TC93 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hs1bp3Q3TC93 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms