Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
NCOA1Q15788 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
NCOA1Q15788 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
NCOA1Q15788 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
NCOA1Q15788 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
NCOA1Q15788 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
NCOA1Q15788 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
NCOA1Q15788 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
NCOA1Q15788 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
NCOA1Q15788 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
NCOA1Q15788 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
NCOA1Q15788 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
NCOA1Q15788 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
NCOA1Q15788 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
NCOA1Q15788 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
NCOA1Q15788 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
NCOA1Q15788 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
NCOA1Q15788 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
NCOA1Q15788 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC33.3■■■□□ 2.92
NCOA1Q15788 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
NCOA1Q15788 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
NCOA1Q15788 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
NCOA1Q15788 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
NCOA1Q15788 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
NCOA1Q15788 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
NCOA1Q15788 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
NCOA1Q15788 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
NCOA1Q15788 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
NCOA1Q15788 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC33.28■■■□□ 2.92
NCOA1Q15788 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
NCOA1Q15788 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
NCOA1Q15788 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
NCOA1Q15788 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
NCOA1Q15788 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
NCOA1Q15788 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
NCOA1Q15788 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
NCOA1Q15788 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC33.28■■■□□ 2.92
NCOA1Q15788 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
NCOA1Q15788 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
NCOA1Q15788 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
NCOA1Q15788 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
NCOA1Q15788 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
NCOA1Q15788 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
NCOA1Q15788 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
NCOA1Q15788 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
NCOA1Q15788 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
NCOA1Q15788 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
NCOA1Q15788 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
NCOA1Q15788 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
NCOA1Q15788 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
NCOA1Q15788 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
NCOA1Q15788 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
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NCOA1Q15788 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
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NCOA1Q15788 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
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NCOA1Q15788 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
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NCOA1Q15788 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
NCOA1Q15788 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
NCOA1Q15788 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
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NCOA1Q15788 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
NCOA1Q15788 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
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NCOA1Q15788 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
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NCOA1Q15788 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
NCOA1Q15788 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
NCOA1Q15788 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
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NCOA1Q15788 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
NCOA1Q15788 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
NCOA1Q15788 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
NCOA1Q15788 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
NCOA1Q15788 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC33.19■■■□□ 2.9
NCOA1Q15788 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
NCOA1Q15788 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
NCOA1Q15788 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
NCOA1Q15788 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
NCOA1Q15788 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
NCOA1Q15788 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
NCOA1Q15788 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
NCOA1Q15788 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
NCOA1Q15788 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
NCOA1Q15788 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
NCOA1Q15788 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
NCOA1Q15788 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
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