Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCARF1Q14162 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCARF1Q14162 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCARF1Q14162 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCARF1Q14162 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCARF1Q14162 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCARF1Q14162 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SCARF1Q14162 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SCARF1Q14162 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SCARF1Q14162 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SCARF1Q14162 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SCARF1Q14162 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SCARF1Q14162 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCARF1Q14162 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SCARF1Q14162 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCARF1Q14162 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SCARF1Q14162 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCARF1Q14162 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCARF1Q14162 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SCARF1Q14162 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCARF1Q14162 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCARF1Q14162 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCARF1Q14162 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SCARF1Q14162 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SCARF1Q14162 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SCARF1Q14162 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SCARF1Q14162 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SCARF1Q14162 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SCARF1Q14162 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SCARF1Q14162 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SCARF1Q14162 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SCARF1Q14162 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SCARF1Q14162 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SCARF1Q14162 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SCARF1Q14162 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SCARF1Q14162 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SCARF1Q14162 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCARF1Q14162 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCARF1Q14162 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCARF1Q14162 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCARF1Q14162 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCARF1Q14162 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCARF1Q14162 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCARF1Q14162 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SCARF1Q14162 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCARF1Q14162 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCARF1Q14162 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCARF1Q14162 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCARF1Q14162 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCARF1Q14162 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SCARF1Q14162 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCARF1Q14162 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCARF1Q14162 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCARF1Q14162 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCARF1Q14162 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCARF1Q14162 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCARF1Q14162 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCARF1Q14162 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCARF1Q14162 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCARF1Q14162 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SCARF1Q14162 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCARF1Q14162 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCARF1Q14162 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCARF1Q14162 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCARF1Q14162 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCARF1Q14162 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCARF1Q14162 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SCARF1Q14162 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCARF1Q14162 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCARF1Q14162 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCARF1Q14162 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCARF1Q14162 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCARF1Q14162 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCARF1Q14162 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCARF1Q14162 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCARF1Q14162 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCARF1Q14162 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCARF1Q14162 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCARF1Q14162 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCARF1Q14162 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCARF1Q14162 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCARF1Q14162 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCARF1Q14162 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCARF1Q14162 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCARF1Q14162 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCARF1Q14162 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCARF1Q14162 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCARF1Q14162 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCARF1Q14162 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SCARF1Q14162 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCARF1Q14162 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCARF1Q14162 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCARF1Q14162 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
SCARF1Q14162 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCARF1Q14162 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCARF1Q14162 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCARF1Q14162 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCARF1Q14162 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCARF1Q14162 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCARF1Q14162 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
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