Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
PKD2Q13563 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
PKD2Q13563 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
PKD2Q13563 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
PKD2Q13563 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
PKD2Q13563 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
PKD2Q13563 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
PKD2Q13563 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
PKD2Q13563 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
PKD2Q13563 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
PKD2Q13563 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
PKD2Q13563 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
PKD2Q13563 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
PKD2Q13563 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
PKD2Q13563 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
PKD2Q13563 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
PKD2Q13563 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
PKD2Q13563 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
PKD2Q13563 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
PKD2Q13563 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
PKD2Q13563 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
PKD2Q13563 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
PKD2Q13563 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
PKD2Q13563 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
PKD2Q13563 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC32.8■■■□□ 2.84
PKD2Q13563 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
PKD2Q13563 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
PKD2Q13563 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
PKD2Q13563 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
PKD2Q13563 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
PKD2Q13563 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
PKD2Q13563 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
PKD2Q13563 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
PKD2Q13563 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
PKD2Q13563 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
PKD2Q13563 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
PKD2Q13563 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
PKD2Q13563 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
PKD2Q13563 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
PKD2Q13563 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
PKD2Q13563 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
PKD2Q13563 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
PKD2Q13563 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
PKD2Q13563 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
PKD2Q13563 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
PKD2Q13563 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
PKD2Q13563 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
PKD2Q13563 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
PKD2Q13563 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
PKD2Q13563 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
PKD2Q13563 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
PKD2Q13563 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
PKD2Q13563 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
PKD2Q13563 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
PKD2Q13563 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
PKD2Q13563 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
PKD2Q13563 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC32.76■■■□□ 2.83
PKD2Q13563 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
PKD2Q13563 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
PKD2Q13563 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
PKD2Q13563 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
PKD2Q13563 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
PKD2Q13563 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
PKD2Q13563 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
PKD2Q13563 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
PKD2Q13563 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
PKD2Q13563 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
PKD2Q13563 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
PKD2Q13563 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
PKD2Q13563 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
PKD2Q13563 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
PKD2Q13563 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
PKD2Q13563 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
PKD2Q13563 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
PKD2Q13563 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
PKD2Q13563 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
PKD2Q13563 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
PKD2Q13563 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
PKD2Q13563 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
PKD2Q13563 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
PKD2Q13563 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
PKD2Q13563 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
PKD2Q13563 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
PKD2Q13563 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
PKD2Q13563 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
PKD2Q13563 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
PKD2Q13563 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
PKD2Q13563 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
PKD2Q13563 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
PKD2Q13563 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
PKD2Q13563 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
PKD2Q13563 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
PKD2Q13563 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC32.72■■■□□ 2.83
PKD2Q13563 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
PKD2Q13563 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
PKD2Q13563 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
PKD2Q13563 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
PKD2Q13563 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
PKD2Q13563 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
PKD2Q13563 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.6 ms