Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIK2Q13002 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIK2Q13002 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIK2Q13002 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIK2Q13002 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIK2Q13002 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIK2Q13002 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIK2Q13002 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIK2Q13002 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIK2Q13002 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIK2Q13002 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIK2Q13002 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIK2Q13002 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIK2Q13002 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIK2Q13002 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIK2Q13002 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIK2Q13002 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIK2Q13002 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIK2Q13002 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIK2Q13002 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIK2Q13002 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIK2Q13002 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIK2Q13002 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIK2Q13002 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIK2Q13002 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIK2Q13002 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIK2Q13002 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIK2Q13002 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIK2Q13002 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIK2Q13002 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIK2Q13002 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIK2Q13002 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIK2Q13002 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIK2Q13002 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIK2Q13002 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIK2Q13002 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIK2Q13002 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIK2Q13002 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIK2Q13002 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIK2Q13002 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIK2Q13002 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIK2Q13002 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIK2Q13002 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIK2Q13002 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIK2Q13002 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIK2Q13002 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIK2Q13002 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIK2Q13002 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIK2Q13002 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIK2Q13002 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIK2Q13002 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIK2Q13002 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIK2Q13002 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIK2Q13002 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIK2Q13002 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIK2Q13002 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIK2Q13002 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIK2Q13002 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIK2Q13002 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIK2Q13002 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIK2Q13002 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIK2Q13002 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIK2Q13002 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIK2Q13002 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIK2Q13002 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIK2Q13002 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIK2Q13002 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIK2Q13002 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIK2Q13002 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIK2Q13002 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIK2Q13002 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIK2Q13002 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIK2Q13002 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIK2Q13002 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIK2Q13002 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIK2Q13002 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIK2Q13002 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIK2Q13002 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIK2Q13002 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIK2Q13002 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIK2Q13002 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIK2Q13002 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIK2Q13002 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIK2Q13002 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIK2Q13002 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIK2Q13002 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIK2Q13002 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIK2Q13002 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIK2Q13002 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIK2Q13002 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIK2Q13002 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIK2Q13002 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIK2Q13002 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIK2Q13002 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GRIK2Q13002 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GRIK2Q13002 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GRIK2Q13002 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GRIK2Q13002 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIK2Q13002 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIK2Q13002 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
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