Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cnn2Q08093 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cnn2Q08093 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Cnn2Q08093 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cnn2Q08093 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cnn2Q08093 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cnn2Q08093 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cnn2Q08093 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cnn2Q08093 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cnn2Q08093 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cnn2Q08093 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cnn2Q08093 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Cnn2Q08093 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cnn2Q08093 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cnn2Q08093 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cnn2Q08093 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cnn2Q08093 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cnn2Q08093 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cnn2Q08093 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cnn2Q08093 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cnn2Q08093 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cnn2Q08093 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cnn2Q08093 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cnn2Q08093 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cnn2Q08093 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cnn2Q08093 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cnn2Q08093 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cnn2Q08093 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Cnn2Q08093 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cnn2Q08093 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cnn2Q08093 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cnn2Q08093 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cnn2Q08093 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cnn2Q08093 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cnn2Q08093 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cnn2Q08093 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cnn2Q08093 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cnn2Q08093 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cnn2Q08093 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cnn2Q08093 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cnn2Q08093 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cnn2Q08093 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cnn2Q08093 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cnn2Q08093 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Cnn2Q08093 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cnn2Q08093 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cnn2Q08093 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cnn2Q08093 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cnn2Q08093 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cnn2Q08093 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cnn2Q08093 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cnn2Q08093 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cnn2Q08093 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Cnn2Q08093 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cnn2Q08093 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cnn2Q08093 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cnn2Q08093 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cnn2Q08093 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cnn2Q08093 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cnn2Q08093 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cnn2Q08093 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cnn2Q08093 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cnn2Q08093 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cnn2Q08093 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cnn2Q08093 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cnn2Q08093 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cnn2Q08093 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cnn2Q08093 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cnn2Q08093 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cnn2Q08093 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cnn2Q08093 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cnn2Q08093 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cnn2Q08093 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cnn2Q08093 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Cnn2Q08093 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cnn2Q08093 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cnn2Q08093 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cnn2Q08093 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cnn2Q08093 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cnn2Q08093 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cnn2Q08093 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cnn2Q08093 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cnn2Q08093 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cnn2Q08093 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cnn2Q08093 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cnn2Q08093 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Cnn2Q08093 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cnn2Q08093 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cnn2Q08093 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cnn2Q08093 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cnn2Q08093 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cnn2Q08093 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cnn2Q08093 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cnn2Q08093 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cnn2Q08093 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cnn2Q08093 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cnn2Q08093 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cnn2Q08093 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cnn2Q08093 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cnn2Q08093 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms