Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FMODQ06828 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FMODQ06828 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FMODQ06828 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FMODQ06828 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FMODQ06828 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FMODQ06828 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FMODQ06828 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FMODQ06828 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FMODQ06828 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
FMODQ06828 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FMODQ06828 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FMODQ06828 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FMODQ06828 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
FMODQ06828 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FMODQ06828 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FMODQ06828 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FMODQ06828 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FMODQ06828 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
FMODQ06828 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FMODQ06828 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FMODQ06828 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FMODQ06828 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FMODQ06828 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
FMODQ06828 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
FMODQ06828 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
FMODQ06828 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
FMODQ06828 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
FMODQ06828 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FMODQ06828 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FMODQ06828 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FMODQ06828 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FMODQ06828 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FMODQ06828 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FMODQ06828 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FMODQ06828 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FMODQ06828 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FMODQ06828 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FMODQ06828 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FMODQ06828 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FMODQ06828 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FMODQ06828 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FMODQ06828 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FMODQ06828 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FMODQ06828 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FMODQ06828 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FMODQ06828 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FMODQ06828 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FMODQ06828 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FMODQ06828 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FMODQ06828 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FMODQ06828 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FMODQ06828 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FMODQ06828 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FMODQ06828 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FMODQ06828 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FMODQ06828 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FMODQ06828 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FMODQ06828 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FMODQ06828 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FMODQ06828 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FMODQ06828 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FMODQ06828 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FMODQ06828 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FMODQ06828 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FMODQ06828 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
FMODQ06828 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FMODQ06828 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FMODQ06828 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FMODQ06828 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FMODQ06828 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FMODQ06828 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FMODQ06828 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
FMODQ06828 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FMODQ06828 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FMODQ06828 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FMODQ06828 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FMODQ06828 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
FMODQ06828 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
FMODQ06828 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FMODQ06828 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FMODQ06828 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
FMODQ06828 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FMODQ06828 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FMODQ06828 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FMODQ06828 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FMODQ06828 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FMODQ06828 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FMODQ06828 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FMODQ06828 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FMODQ06828 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FMODQ06828 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FMODQ06828 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FMODQ06828 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
FMODQ06828 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
FMODQ06828 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
FMODQ06828 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
FMODQ06828 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FMODQ06828 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FMODQ06828 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms