Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBXN1Q04323 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBXN1Q04323 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBXN1Q04323 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBXN1Q04323 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
UBXN1Q04323 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
UBXN1Q04323 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBXN1Q04323 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBXN1Q04323 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBXN1Q04323 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBXN1Q04323 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBXN1Q04323 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBXN1Q04323 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBXN1Q04323 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBXN1Q04323 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBXN1Q04323 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBXN1Q04323 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBXN1Q04323 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
UBXN1Q04323 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBXN1Q04323 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBXN1Q04323 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBXN1Q04323 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBXN1Q04323 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
UBXN1Q04323 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
UBXN1Q04323 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
UBXN1Q04323 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBXN1Q04323 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBXN1Q04323 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBXN1Q04323 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBXN1Q04323 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBXN1Q04323 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBXN1Q04323 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBXN1Q04323 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBXN1Q04323 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBXN1Q04323 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBXN1Q04323 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBXN1Q04323 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBXN1Q04323 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBXN1Q04323 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBXN1Q04323 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBXN1Q04323 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBXN1Q04323 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBXN1Q04323 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBXN1Q04323 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
UBXN1Q04323 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBXN1Q04323 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBXN1Q04323 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBXN1Q04323 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBXN1Q04323 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBXN1Q04323 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBXN1Q04323 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBXN1Q04323 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBXN1Q04323 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBXN1Q04323 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBXN1Q04323 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBXN1Q04323 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBXN1Q04323 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBXN1Q04323 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
UBXN1Q04323 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBXN1Q04323 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBXN1Q04323 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBXN1Q04323 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBXN1Q04323 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBXN1Q04323 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBXN1Q04323 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBXN1Q04323 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBXN1Q04323 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBXN1Q04323 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBXN1Q04323 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBXN1Q04323 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBXN1Q04323 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBXN1Q04323 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBXN1Q04323 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBXN1Q04323 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBXN1Q04323 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBXN1Q04323 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBXN1Q04323 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBXN1Q04323 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBXN1Q04323 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBXN1Q04323 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBXN1Q04323 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBXN1Q04323 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
UBXN1Q04323 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBXN1Q04323 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBXN1Q04323 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBXN1Q04323 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBXN1Q04323 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
UBXN1Q04323 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBXN1Q04323 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
UBXN1Q04323 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBXN1Q04323 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBXN1Q04323 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBXN1Q04323 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBXN1Q04323 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBXN1Q04323 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBXN1Q04323 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBXN1Q04323 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBXN1Q04323 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBXN1Q04323 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
UBXN1Q04323 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms