Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Thbs2Q03350 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Thbs2Q03350 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Thbs2Q03350 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Thbs2Q03350 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Thbs2Q03350 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Thbs2Q03350 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Thbs2Q03350 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Thbs2Q03350 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Thbs2Q03350 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Thbs2Q03350 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Thbs2Q03350 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Thbs2Q03350 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Thbs2Q03350 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Thbs2Q03350 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Thbs2Q03350 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Thbs2Q03350 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Thbs2Q03350 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Thbs2Q03350 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Thbs2Q03350 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Thbs2Q03350 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Thbs2Q03350 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Thbs2Q03350 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Thbs2Q03350 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Thbs2Q03350 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Thbs2Q03350 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Thbs2Q03350 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Thbs2Q03350 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Thbs2Q03350 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Thbs2Q03350 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Thbs2Q03350 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Thbs2Q03350 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Thbs2Q03350 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Thbs2Q03350 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Thbs2Q03350 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Thbs2Q03350 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Thbs2Q03350 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Thbs2Q03350 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Thbs2Q03350 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Thbs2Q03350 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Thbs2Q03350 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Thbs2Q03350 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Thbs2Q03350 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Thbs2Q03350 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Thbs2Q03350 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Thbs2Q03350 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Thbs2Q03350 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Thbs2Q03350 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Thbs2Q03350 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Thbs2Q03350 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Thbs2Q03350 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Thbs2Q03350 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Thbs2Q03350 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Thbs2Q03350 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Thbs2Q03350 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Thbs2Q03350 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Thbs2Q03350 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Thbs2Q03350 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Thbs2Q03350 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Thbs2Q03350 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Thbs2Q03350 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Thbs2Q03350 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Thbs2Q03350 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Thbs2Q03350 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Thbs2Q03350 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Thbs2Q03350 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Thbs2Q03350 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Thbs2Q03350 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Thbs2Q03350 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Thbs2Q03350 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Thbs2Q03350 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Thbs2Q03350 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Thbs2Q03350 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Thbs2Q03350 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Thbs2Q03350 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Thbs2Q03350 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Thbs2Q03350 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Thbs2Q03350 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Thbs2Q03350 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Thbs2Q03350 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Thbs2Q03350 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Thbs2Q03350 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Thbs2Q03350 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Thbs2Q03350 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Thbs2Q03350 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Thbs2Q03350 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Thbs2Q03350 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Thbs2Q03350 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Thbs2Q03350 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Thbs2Q03350 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Thbs2Q03350 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Thbs2Q03350 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Thbs2Q03350 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Thbs2Q03350 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Thbs2Q03350 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Thbs2Q03350 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Thbs2Q03350 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Thbs2Q03350 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Thbs2Q03350 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Thbs2Q03350 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms