Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HERVK_113P62684 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
HERVK_113P62684 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HERVK_113P62684 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HERVK_113P62684 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HERVK_113P62684 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HERVK_113P62684 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HERVK_113P62684 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HERVK_113P62684 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HERVK_113P62684 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HERVK_113P62684 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HERVK_113P62684 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HERVK_113P62684 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HERVK_113P62684 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HERVK_113P62684 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HERVK_113P62684 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HERVK_113P62684 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HERVK_113P62684 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HERVK_113P62684 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HERVK_113P62684 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HERVK_113P62684 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HERVK_113P62684 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HERVK_113P62684 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HERVK_113P62684 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HERVK_113P62684 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HERVK_113P62684 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HERVK_113P62684 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HERVK_113P62684 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HERVK_113P62684 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HERVK_113P62684 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HERVK_113P62684 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HERVK_113P62684 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
HERVK_113P62684 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HERVK_113P62684 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HERVK_113P62684 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HERVK_113P62684 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HERVK_113P62684 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HERVK_113P62684 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HERVK_113P62684 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HERVK_113P62684 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HERVK_113P62684 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HERVK_113P62684 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HERVK_113P62684 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HERVK_113P62684 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HERVK_113P62684 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HERVK_113P62684 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HERVK_113P62684 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
HERVK_113P62684 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HERVK_113P62684 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HERVK_113P62684 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HERVK_113P62684 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HERVK_113P62684 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HERVK_113P62684 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HERVK_113P62684 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HERVK_113P62684 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HERVK_113P62684 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HERVK_113P62684 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HERVK_113P62684 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HERVK_113P62684 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HERVK_113P62684 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HERVK_113P62684 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HERVK_113P62684 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HERVK_113P62684 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HERVK_113P62684 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HERVK_113P62684 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HERVK_113P62684 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HERVK_113P62684 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HERVK_113P62684 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HERVK_113P62684 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HERVK_113P62684 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HERVK_113P62684 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HERVK_113P62684 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HERVK_113P62684 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HERVK_113P62684 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HERVK_113P62684 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HERVK_113P62684 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HERVK_113P62684 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HERVK_113P62684 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HERVK_113P62684 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HERVK_113P62684 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HERVK_113P62684 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HERVK_113P62684 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HERVK_113P62684 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HERVK_113P62684 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HERVK_113P62684 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HERVK_113P62684 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HERVK_113P62684 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HERVK_113P62684 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HERVK_113P62684 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HERVK_113P62684 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HERVK_113P62684 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HERVK_113P62684 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
HERVK_113P62684 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HERVK_113P62684 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HERVK_113P62684 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HERVK_113P62684 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
HERVK_113P62684 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
HERVK_113P62684 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HERVK_113P62684 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HERVK_113P62684 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms