Protein–RNA interactions for Protein: P56916

Gsc2, Homeobox protein goosecoid-2, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsc2P56916 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gsc2P56916 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gsc2P56916 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gsc2P56916 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gsc2P56916 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gsc2P56916 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gsc2P56916 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gsc2P56916 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gsc2P56916 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gsc2P56916 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gsc2P56916 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gsc2P56916 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gsc2P56916 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gsc2P56916 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gsc2P56916 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gsc2P56916 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gsc2P56916 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gsc2P56916 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gsc2P56916 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gsc2P56916 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gsc2P56916 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gsc2P56916 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gsc2P56916 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gsc2P56916 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gsc2P56916 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gsc2P56916 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gsc2P56916 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gsc2P56916 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gsc2P56916 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gsc2P56916 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gsc2P56916 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gsc2P56916 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gsc2P56916 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gsc2P56916 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gsc2P56916 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gsc2P56916 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gsc2P56916 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gsc2P56916 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gsc2P56916 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gsc2P56916 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gsc2P56916 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gsc2P56916 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gsc2P56916 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gsc2P56916 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gsc2P56916 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gsc2P56916 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gsc2P56916 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gsc2P56916 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gsc2P56916 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gsc2P56916 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gsc2P56916 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gsc2P56916 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gsc2P56916 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gsc2P56916 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gsc2P56916 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gsc2P56916 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gsc2P56916 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gsc2P56916 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gsc2P56916 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gsc2P56916 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gsc2P56916 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gsc2P56916 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gsc2P56916 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gsc2P56916 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gsc2P56916 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gsc2P56916 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gsc2P56916 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gsc2P56916 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gsc2P56916 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gsc2P56916 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gsc2P56916 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gsc2P56916 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gsc2P56916 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gsc2P56916 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gsc2P56916 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gsc2P56916 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gsc2P56916 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gsc2P56916 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gsc2P56916 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gsc2P56916 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gsc2P56916 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gsc2P56916 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gsc2P56916 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gsc2P56916 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gsc2P56916 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gsc2P56916 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gsc2P56916 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gsc2P56916 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gsc2P56916 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gsc2P56916 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gsc2P56916 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gsc2P56916 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gsc2P56916 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gsc2P56916 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gsc2P56916 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gsc2P56916 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gsc2P56916 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gsc2P56916 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gsc2P56916 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gsc2P56916 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms