Protein–RNA interactions for Protein: P56213

Gfer, FAD-linked sulfhydryl oxidase ALR, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GferP56213 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GferP56213 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GferP56213 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GferP56213 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
GferP56213 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GferP56213 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GferP56213 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GferP56213 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GferP56213 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GferP56213 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GferP56213 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GferP56213 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GferP56213 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GferP56213 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GferP56213 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GferP56213 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GferP56213 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GferP56213 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GferP56213 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GferP56213 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GferP56213 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GferP56213 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GferP56213 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GferP56213 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GferP56213 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GferP56213 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GferP56213 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GferP56213 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GferP56213 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GferP56213 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GferP56213 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GferP56213 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GferP56213 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GferP56213 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GferP56213 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GferP56213 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GferP56213 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GferP56213 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GferP56213 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GferP56213 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GferP56213 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GferP56213 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GferP56213 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GferP56213 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GferP56213 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GferP56213 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GferP56213 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GferP56213 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GferP56213 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GferP56213 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GferP56213 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GferP56213 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GferP56213 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GferP56213 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GferP56213 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GferP56213 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GferP56213 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GferP56213 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GferP56213 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GferP56213 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GferP56213 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GferP56213 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GferP56213 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GferP56213 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GferP56213 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GferP56213 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GferP56213 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GferP56213 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GferP56213 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GferP56213 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GferP56213 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GferP56213 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GferP56213 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GferP56213 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GferP56213 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GferP56213 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GferP56213 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GferP56213 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GferP56213 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GferP56213 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GferP56213 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GferP56213 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
GferP56213 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GferP56213 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GferP56213 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GferP56213 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GferP56213 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GferP56213 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GferP56213 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GferP56213 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GferP56213 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GferP56213 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GferP56213 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GferP56213 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GferP56213 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GferP56213 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GferP56213 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GferP56213 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GferP56213 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GferP56213 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms