Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CASP9P55211 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CASP9P55211 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CASP9P55211 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CASP9P55211 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CASP9P55211 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CASP9P55211 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CASP9P55211 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CASP9P55211 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CASP9P55211 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CASP9P55211 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CASP9P55211 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CASP9P55211 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CASP9P55211 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CASP9P55211 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CASP9P55211 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CASP9P55211 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CASP9P55211 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CASP9P55211 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CASP9P55211 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CASP9P55211 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CASP9P55211 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CASP9P55211 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CASP9P55211 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CASP9P55211 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CASP9P55211 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CASP9P55211 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CASP9P55211 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CASP9P55211 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CASP9P55211 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CASP9P55211 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CASP9P55211 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CASP9P55211 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CASP9P55211 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CASP9P55211 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CASP9P55211 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CASP9P55211 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CASP9P55211 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CASP9P55211 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CASP9P55211 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CASP9P55211 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CASP9P55211 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CASP9P55211 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CASP9P55211 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CASP9P55211 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CASP9P55211 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CASP9P55211 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CASP9P55211 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CASP9P55211 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CASP9P55211 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CASP9P55211 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CASP9P55211 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CASP9P55211 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CASP9P55211 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CASP9P55211 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CASP9P55211 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CASP9P55211 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CASP9P55211 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CASP9P55211 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CASP9P55211 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CASP9P55211 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CASP9P55211 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CASP9P55211 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CASP9P55211 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CASP9P55211 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CASP9P55211 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CASP9P55211 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CASP9P55211 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CASP9P55211 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CASP9P55211 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CASP9P55211 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CASP9P55211 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CASP9P55211 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CASP9P55211 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CASP9P55211 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CASP9P55211 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CASP9P55211 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CASP9P55211 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CASP9P55211 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CASP9P55211 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CASP9P55211 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CASP9P55211 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CASP9P55211 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CASP9P55211 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CASP9P55211 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CASP9P55211 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CASP9P55211 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CASP9P55211 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CASP9P55211 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CASP9P55211 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CASP9P55211 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CASP9P55211 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CASP9P55211 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CASP9P55211 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CASP9P55211 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CASP9P55211 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CASP9P55211 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CASP9P55211 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CASP9P55211 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CASP9P55211 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms