Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTNNB1P35222 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTNNB1P35222 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTNNB1P35222 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTNNB1P35222 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTNNB1P35222 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTNNB1P35222 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CTNNB1P35222 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTNNB1P35222 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTNNB1P35222 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTNNB1P35222 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTNNB1P35222 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTNNB1P35222 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTNNB1P35222 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTNNB1P35222 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTNNB1P35222 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTNNB1P35222 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTNNB1P35222 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTNNB1P35222 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CTNNB1P35222 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CTNNB1P35222 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CTNNB1P35222 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTNNB1P35222 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTNNB1P35222 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTNNB1P35222 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTNNB1P35222 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTNNB1P35222 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTNNB1P35222 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTNNB1P35222 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTNNB1P35222 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTNNB1P35222 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTNNB1P35222 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTNNB1P35222 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTNNB1P35222 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTNNB1P35222 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTNNB1P35222 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTNNB1P35222 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTNNB1P35222 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTNNB1P35222 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTNNB1P35222 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTNNB1P35222 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTNNB1P35222 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTNNB1P35222 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTNNB1P35222 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTNNB1P35222 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTNNB1P35222 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTNNB1P35222 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTNNB1P35222 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTNNB1P35222 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTNNB1P35222 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTNNB1P35222 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CTNNB1P35222 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTNNB1P35222 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTNNB1P35222 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTNNB1P35222 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTNNB1P35222 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTNNB1P35222 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTNNB1P35222 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CTNNB1P35222 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTNNB1P35222 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTNNB1P35222 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTNNB1P35222 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTNNB1P35222 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTNNB1P35222 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTNNB1P35222 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTNNB1P35222 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTNNB1P35222 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTNNB1P35222 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTNNB1P35222 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CTNNB1P35222 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTNNB1P35222 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTNNB1P35222 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTNNB1P35222 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTNNB1P35222 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTNNB1P35222 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTNNB1P35222 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTNNB1P35222 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTNNB1P35222 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTNNB1P35222 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTNNB1P35222 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTNNB1P35222 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTNNB1P35222 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTNNB1P35222 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTNNB1P35222 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTNNB1P35222 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CTNNB1P35222 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTNNB1P35222 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTNNB1P35222 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTNNB1P35222 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTNNB1P35222 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTNNB1P35222 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTNNB1P35222 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTNNB1P35222 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTNNB1P35222 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CTNNB1P35222 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTNNB1P35222 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTNNB1P35222 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTNNB1P35222 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTNNB1P35222 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTNNB1P35222 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms