Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gjc1P28229 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gjc1P28229 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gjc1P28229 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gjc1P28229 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gjc1P28229 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gjc1P28229 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gjc1P28229 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gjc1P28229 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gjc1P28229 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gjc1P28229 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gjc1P28229 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gjc1P28229 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gjc1P28229 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Gjc1P28229 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gjc1P28229 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gjc1P28229 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gjc1P28229 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gjc1P28229 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Gjc1P28229 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gjc1P28229 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gjc1P28229 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gjc1P28229 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gjc1P28229 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gjc1P28229 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gjc1P28229 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Gjc1P28229 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gjc1P28229 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gjc1P28229 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gjc1P28229 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gjc1P28229 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gjc1P28229 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gjc1P28229 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gjc1P28229 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gjc1P28229 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gjc1P28229 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gjc1P28229 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gjc1P28229 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gjc1P28229 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gjc1P28229 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gjc1P28229 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gjc1P28229 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Gjc1P28229 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Gjc1P28229 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gjc1P28229 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gjc1P28229 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Gjc1P28229 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gjc1P28229 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gjc1P28229 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gjc1P28229 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gjc1P28229 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Gjc1P28229 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gjc1P28229 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Gjc1P28229 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gjc1P28229 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gjc1P28229 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gjc1P28229 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gjc1P28229 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gjc1P28229 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gjc1P28229 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gjc1P28229 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gjc1P28229 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gjc1P28229 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gjc1P28229 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gjc1P28229 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gjc1P28229 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gjc1P28229 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gjc1P28229 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gjc1P28229 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gjc1P28229 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gjc1P28229 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gjc1P28229 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gjc1P28229 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gjc1P28229 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gjc1P28229 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gjc1P28229 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gjc1P28229 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Gjc1P28229 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gjc1P28229 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gjc1P28229 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gjc1P28229 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Gjc1P28229 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gjc1P28229 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gjc1P28229 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gjc1P28229 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gjc1P28229 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gjc1P28229 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gjc1P28229 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gjc1P28229 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gjc1P28229 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gjc1P28229 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gjc1P28229 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gjc1P28229 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Gjc1P28229 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gjc1P28229 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gjc1P28229 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gjc1P28229 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gjc1P28229 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.95
Gjc1P28229 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
Gjc1P28229 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms