Protein–RNA interactions for Protein: P23634

ATP2B4, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B4P23634 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP2B4P23634 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP2B4P23634 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP2B4P23634 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP2B4P23634 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP2B4P23634 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP2B4P23634 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP2B4P23634 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP2B4P23634 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP2B4P23634 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP2B4P23634 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP2B4P23634 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP2B4P23634 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP2B4P23634 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP2B4P23634 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATP2B4P23634 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATP2B4P23634 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATP2B4P23634 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATP2B4P23634 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATP2B4P23634 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATP2B4P23634 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATP2B4P23634 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATP2B4P23634 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATP2B4P23634 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATP2B4P23634 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATP2B4P23634 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATP2B4P23634 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATP2B4P23634 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATP2B4P23634 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATP2B4P23634 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATP2B4P23634 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATP2B4P23634 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
ATP2B4P23634 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATP2B4P23634 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATP2B4P23634 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP2B4P23634 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP2B4P23634 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP2B4P23634 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP2B4P23634 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP2B4P23634 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP2B4P23634 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP2B4P23634 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP2B4P23634 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP2B4P23634 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP2B4P23634 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP2B4P23634 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP2B4P23634 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP2B4P23634 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP2B4P23634 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP2B4P23634 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP2B4P23634 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP2B4P23634 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP2B4P23634 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP2B4P23634 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP2B4P23634 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP2B4P23634 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP2B4P23634 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP2B4P23634 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP2B4P23634 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP2B4P23634 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP2B4P23634 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATP2B4P23634 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATP2B4P23634 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
ATP2B4P23634 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATP2B4P23634 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATP2B4P23634 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATP2B4P23634 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATP2B4P23634 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATP2B4P23634 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATP2B4P23634 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATP2B4P23634 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ATP2B4P23634 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ATP2B4P23634 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ATP2B4P23634 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ATP2B4P23634 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ATP2B4P23634 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ATP2B4P23634 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC27■■□□□ 1.91
ATP2B4P23634 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ATP2B4P23634 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC27■■□□□ 1.91
ATP2B4P23634 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ATP2B4P23634 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATP2B4P23634 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATP2B4P23634 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATP2B4P23634 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATP2B4P23634 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
ATP2B4P23634 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATP2B4P23634 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
ATP2B4P23634 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATP2B4P23634 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATP2B4P23634 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATP2B4P23634 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP2B4P23634 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP2B4P23634 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP2B4P23634 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP2B4P23634 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP2B4P23634 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP2B4P23634 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP2B4P23634 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP2B4P23634 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATP2B4P23634 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms