Protein–RNA interactions for Protein: P07349

Ifna5, Interferon alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna5P07349 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifna5P07349 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifna5P07349 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifna5P07349 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifna5P07349 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifna5P07349 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifna5P07349 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifna5P07349 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifna5P07349 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifna5P07349 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifna5P07349 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifna5P07349 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifna5P07349 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifna5P07349 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifna5P07349 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifna5P07349 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifna5P07349 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifna5P07349 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifna5P07349 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifna5P07349 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifna5P07349 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifna5P07349 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifna5P07349 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifna5P07349 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifna5P07349 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifna5P07349 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifna5P07349 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifna5P07349 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifna5P07349 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifna5P07349 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifna5P07349 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifna5P07349 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifna5P07349 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifna5P07349 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifna5P07349 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifna5P07349 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifna5P07349 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifna5P07349 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifna5P07349 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ifna5P07349 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Ifna5P07349 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ifna5P07349 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ifna5P07349 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ifna5P07349 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ifna5P07349 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifna5P07349 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifna5P07349 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifna5P07349 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifna5P07349 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifna5P07349 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifna5P07349 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifna5P07349 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifna5P07349 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifna5P07349 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifna5P07349 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifna5P07349 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifna5P07349 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifna5P07349 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifna5P07349 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifna5P07349 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifna5P07349 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifna5P07349 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifna5P07349 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifna5P07349 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifna5P07349 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifna5P07349 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifna5P07349 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifna5P07349 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifna5P07349 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifna5P07349 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifna5P07349 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifna5P07349 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifna5P07349 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifna5P07349 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifna5P07349 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifna5P07349 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifna5P07349 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifna5P07349 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifna5P07349 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifna5P07349 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifna5P07349 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifna5P07349 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifna5P07349 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifna5P07349 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifna5P07349 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifna5P07349 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifna5P07349 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifna5P07349 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifna5P07349 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifna5P07349 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifna5P07349 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifna5P07349 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifna5P07349 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifna5P07349 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifna5P07349 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifna5P07349 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifna5P07349 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifna5P07349 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifna5P07349 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifna5P07349 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms