Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TtrP07309 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TtrP07309 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TtrP07309 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TtrP07309 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TtrP07309 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
TtrP07309 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TtrP07309 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TtrP07309 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TtrP07309 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TtrP07309 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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TtrP07309 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
TtrP07309 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TtrP07309 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TtrP07309 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TtrP07309 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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TtrP07309 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
TtrP07309 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TtrP07309 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TtrP07309 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TtrP07309 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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TtrP07309 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TtrP07309 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TtrP07309 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
TtrP07309 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TtrP07309 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TtrP07309 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TtrP07309 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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TtrP07309 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TtrP07309 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TtrP07309 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TtrP07309 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TtrP07309 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TtrP07309 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TtrP07309 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TtrP07309 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TtrP07309 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
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TtrP07309 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TtrP07309 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TtrP07309 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TtrP07309 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TtrP07309 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TtrP07309 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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TtrP07309 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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TtrP07309 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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TtrP07309 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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TtrP07309 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TtrP07309 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TtrP07309 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TtrP07309 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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TtrP07309 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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TtrP07309 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TtrP07309 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TtrP07309 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TtrP07309 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TtrP07309 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
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TtrP07309 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TtrP07309 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TtrP07309 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TtrP07309 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TtrP07309 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TtrP07309 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TtrP07309 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TtrP07309 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TtrP07309 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TtrP07309 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TtrP07309 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TtrP07309 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TtrP07309 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TtrP07309 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TtrP07309 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TtrP07309 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TtrP07309 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TtrP07309 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TtrP07309 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TtrP07309 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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