Protein–RNA interactions for Protein: O43312

MTSS1, Metastasis suppressor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1O43312 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTSS1O43312 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTSS1O43312 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTSS1O43312 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTSS1O43312 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTSS1O43312 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTSS1O43312 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTSS1O43312 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MTSS1O43312 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MTSS1O43312 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTSS1O43312 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTSS1O43312 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTSS1O43312 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
MTSS1O43312 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTSS1O43312 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTSS1O43312 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTSS1O43312 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTSS1O43312 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTSS1O43312 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
MTSS1O43312 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTSS1O43312 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTSS1O43312 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTSS1O43312 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTSS1O43312 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTSS1O43312 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTSS1O43312 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTSS1O43312 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTSS1O43312 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTSS1O43312 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTSS1O43312 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTSS1O43312 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTSS1O43312 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTSS1O43312 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MTSS1O43312 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MTSS1O43312 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MTSS1O43312 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTSS1O43312 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTSS1O43312 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTSS1O43312 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTSS1O43312 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MTSS1O43312 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTSS1O43312 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTSS1O43312 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTSS1O43312 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTSS1O43312 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTSS1O43312 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTSS1O43312 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MTSS1O43312 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MTSS1O43312 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MTSS1O43312 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MTSS1O43312 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MTSS1O43312 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MTSS1O43312 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MTSS1O43312 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MTSS1O43312 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MTSS1O43312 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MTSS1O43312 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MTSS1O43312 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MTSS1O43312 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MTSS1O43312 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MTSS1O43312 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MTSS1O43312 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MTSS1O43312 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MTSS1O43312 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MTSS1O43312 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MTSS1O43312 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MTSS1O43312 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MTSS1O43312 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MTSS1O43312 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MTSS1O43312 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MTSS1O43312 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MTSS1O43312 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MTSS1O43312 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MTSS1O43312 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MTSS1O43312 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MTSS1O43312 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MTSS1O43312 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MTSS1O43312 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MTSS1O43312 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MTSS1O43312 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MTSS1O43312 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MTSS1O43312 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MTSS1O43312 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MTSS1O43312 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MTSS1O43312 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MTSS1O43312 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MTSS1O43312 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MTSS1O43312 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MTSS1O43312 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MTSS1O43312 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MTSS1O43312 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MTSS1O43312 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MTSS1O43312 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MTSS1O43312 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MTSS1O43312 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MTSS1O43312 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MTSS1O43312 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MTSS1O43312 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MTSS1O43312 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MTSS1O43312 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms