Protein–RNA interactions for Protein: O14802

POLR3A, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3AO14802 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
POLR3AO14802 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
POLR3AO14802 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
POLR3AO14802 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
POLR3AO14802 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
POLR3AO14802 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
POLR3AO14802 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
POLR3AO14802 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
POLR3AO14802 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
POLR3AO14802 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
POLR3AO14802 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
POLR3AO14802 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
POLR3AO14802 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
POLR3AO14802 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
POLR3AO14802 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
POLR3AO14802 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
POLR3AO14802 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
POLR3AO14802 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
POLR3AO14802 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
POLR3AO14802 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
POLR3AO14802 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
POLR3AO14802 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
POLR3AO14802 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
POLR3AO14802 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
POLR3AO14802 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
POLR3AO14802 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
POLR3AO14802 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC30.54■■■□□ 2.48
POLR3AO14802 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
POLR3AO14802 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
POLR3AO14802 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
POLR3AO14802 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
POLR3AO14802 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
POLR3AO14802 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
POLR3AO14802 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
POLR3AO14802 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
POLR3AO14802 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
POLR3AO14802 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
POLR3AO14802 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC30.53■■■□□ 2.48
POLR3AO14802 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
POLR3AO14802 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
POLR3AO14802 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
POLR3AO14802 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
POLR3AO14802 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
POLR3AO14802 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
POLR3AO14802 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
POLR3AO14802 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
POLR3AO14802 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
POLR3AO14802 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
POLR3AO14802 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
POLR3AO14802 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
POLR3AO14802 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
POLR3AO14802 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
POLR3AO14802 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
POLR3AO14802 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
POLR3AO14802 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
POLR3AO14802 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
POLR3AO14802 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
POLR3AO14802 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
POLR3AO14802 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
POLR3AO14802 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
POLR3AO14802 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
POLR3AO14802 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
POLR3AO14802 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC30.5■■■□□ 2.47
POLR3AO14802 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC30.5■■■□□ 2.47
POLR3AO14802 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
POLR3AO14802 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
POLR3AO14802 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
POLR3AO14802 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
POLR3AO14802 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
POLR3AO14802 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
POLR3AO14802 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
POLR3AO14802 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
POLR3AO14802 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
POLR3AO14802 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
POLR3AO14802 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
POLR3AO14802 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
POLR3AO14802 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
POLR3AO14802 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
POLR3AO14802 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
POLR3AO14802 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
POLR3AO14802 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
POLR3AO14802 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
POLR3AO14802 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
POLR3AO14802 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
POLR3AO14802 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
POLR3AO14802 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
POLR3AO14802 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
POLR3AO14802 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
POLR3AO14802 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
POLR3AO14802 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
POLR3AO14802 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
POLR3AO14802 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
POLR3AO14802 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
POLR3AO14802 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
POLR3AO14802 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
POLR3AO14802 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
POLR3AO14802 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
POLR3AO14802 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
POLR3AO14802 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
POLR3AO14802 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms