Protein–RNA interactions for Protein: O00268

TAF4, Transcription initiation factor TFIID subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4O00268 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TAF4O00268 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TAF4O00268 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TAF4O00268 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TAF4O00268 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TAF4O00268 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF4O00268 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF4O00268 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF4O00268 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF4O00268 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF4O00268 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF4O00268 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF4O00268 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF4O00268 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF4O00268 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF4O00268 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF4O00268 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF4O00268 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF4O00268 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF4O00268 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF4O00268 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF4O00268 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF4O00268 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF4O00268 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF4O00268 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF4O00268 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF4O00268 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF4O00268 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF4O00268 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF4O00268 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF4O00268 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF4O00268 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF4O00268 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF4O00268 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF4O00268 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF4O00268 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF4O00268 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF4O00268 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF4O00268 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF4O00268 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF4O00268 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF4O00268 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF4O00268 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF4O00268 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF4O00268 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF4O00268 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF4O00268 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF4O00268 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF4O00268 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF4O00268 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF4O00268 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF4O00268 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF4O00268 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TAF4O00268 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TAF4O00268 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TAF4O00268 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TAF4O00268 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TAF4O00268 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TAF4O00268 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TAF4O00268 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TAF4O00268 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF4O00268 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF4O00268 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF4O00268 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF4O00268 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF4O00268 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF4O00268 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF4O00268 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF4O00268 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF4O00268 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF4O00268 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF4O00268 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF4O00268 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF4O00268 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF4O00268 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF4O00268 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF4O00268 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF4O00268 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF4O00268 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF4O00268 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF4O00268 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
TAF4O00268 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TAF4O00268 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TAF4O00268 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TAF4O00268 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
TAF4O00268 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TAF4O00268 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF4O00268 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF4O00268 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF4O00268 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF4O00268 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF4O00268 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF4O00268 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF4O00268 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF4O00268 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF4O00268 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF4O00268 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF4O00268 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF4O00268 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TAF4O00268 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms