Protein–RNA interactions for Protein: F8VQK7

Gm16519, Predicted gene, 16519, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm16519F8VQK7 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm16519F8VQK7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm16519F8VQK7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm16519F8VQK7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm16519F8VQK7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm16519F8VQK7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm16519F8VQK7 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm16519F8VQK7 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm16519F8VQK7 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm16519F8VQK7 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm16519F8VQK7 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm16519F8VQK7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm16519F8VQK7 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm16519F8VQK7 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm16519F8VQK7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm16519F8VQK7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm16519F8VQK7 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm16519F8VQK7 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm16519F8VQK7 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm16519F8VQK7 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm16519F8VQK7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm16519F8VQK7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm16519F8VQK7 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm16519F8VQK7 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm16519F8VQK7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm16519F8VQK7 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm16519F8VQK7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm16519F8VQK7 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm16519F8VQK7 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm16519F8VQK7 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm16519F8VQK7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm16519F8VQK7 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm16519F8VQK7 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm16519F8VQK7 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm16519F8VQK7 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm16519F8VQK7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm16519F8VQK7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm16519F8VQK7 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm16519F8VQK7 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm16519F8VQK7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm16519F8VQK7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm16519F8VQK7 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm16519F8VQK7 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm16519F8VQK7 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm16519F8VQK7 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm16519F8VQK7 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm16519F8VQK7 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm16519F8VQK7 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm16519F8VQK7 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm16519F8VQK7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm16519F8VQK7 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm16519F8VQK7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm16519F8VQK7 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm16519F8VQK7 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm16519F8VQK7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm16519F8VQK7 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm16519F8VQK7 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm16519F8VQK7 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm16519F8VQK7 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm16519F8VQK7 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm16519F8VQK7 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm16519F8VQK7 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm16519F8VQK7 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm16519F8VQK7 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm16519F8VQK7 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm16519F8VQK7 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm16519F8VQK7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm16519F8VQK7 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm16519F8VQK7 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm16519F8VQK7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm16519F8VQK7 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm16519F8VQK7 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm16519F8VQK7 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm16519F8VQK7 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm16519F8VQK7 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm16519F8VQK7 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm16519F8VQK7 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm16519F8VQK7 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm16519F8VQK7 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm16519F8VQK7 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm16519F8VQK7 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm16519F8VQK7 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm16519F8VQK7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm16519F8VQK7 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm16519F8VQK7 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm16519F8VQK7 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm16519F8VQK7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm16519F8VQK7 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm16519F8VQK7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm16519F8VQK7 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm16519F8VQK7 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm16519F8VQK7 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm16519F8VQK7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm16519F8VQK7 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm16519F8VQK7 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm16519F8VQK7 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm16519F8VQK7 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm16519F8VQK7 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm16519F8VQK7 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm16519F8VQK7 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms