Protein–RNA interactions for Protein: E9QLQ1

Defa35, Defensin, alpha, 35, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa35E9QLQ1 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Defa35E9QLQ1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Defa35E9QLQ1 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Defa35E9QLQ1 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Defa35E9QLQ1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Defa35E9QLQ1 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Defa35E9QLQ1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Defa35E9QLQ1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Defa35E9QLQ1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Defa35E9QLQ1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Defa35E9QLQ1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Defa35E9QLQ1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Defa35E9QLQ1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Defa35E9QLQ1 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Defa35E9QLQ1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Defa35E9QLQ1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Defa35E9QLQ1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Defa35E9QLQ1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Defa35E9QLQ1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Defa35E9QLQ1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Defa35E9QLQ1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Defa35E9QLQ1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Defa35E9QLQ1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Defa35E9QLQ1 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Defa35E9QLQ1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Defa35E9QLQ1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Defa35E9QLQ1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Defa35E9QLQ1 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Defa35E9QLQ1 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Defa35E9QLQ1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Defa35E9QLQ1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Defa35E9QLQ1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Defa35E9QLQ1 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Defa35E9QLQ1 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Defa35E9QLQ1 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Defa35E9QLQ1 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Defa35E9QLQ1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Defa35E9QLQ1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Defa35E9QLQ1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Defa35E9QLQ1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Defa35E9QLQ1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Defa35E9QLQ1 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Defa35E9QLQ1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Defa35E9QLQ1 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Defa35E9QLQ1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Defa35E9QLQ1 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Defa35E9QLQ1 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Defa35E9QLQ1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Defa35E9QLQ1 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Defa35E9QLQ1 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Defa35E9QLQ1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Defa35E9QLQ1 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Defa35E9QLQ1 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Defa35E9QLQ1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Defa35E9QLQ1 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Defa35E9QLQ1 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Defa35E9QLQ1 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Defa35E9QLQ1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Defa35E9QLQ1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Defa35E9QLQ1 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa35E9QLQ1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa35E9QLQ1 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa35E9QLQ1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa35E9QLQ1 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa35E9QLQ1 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa35E9QLQ1 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa35E9QLQ1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa35E9QLQ1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa35E9QLQ1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa35E9QLQ1 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa35E9QLQ1 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa35E9QLQ1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa35E9QLQ1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa35E9QLQ1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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