Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ57

Mterf1b, Transcription termination factor 1b, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf1bB9EJ57 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mterf1bB9EJ57 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mterf1bB9EJ57 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mterf1bB9EJ57 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mterf1bB9EJ57 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mterf1bB9EJ57 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mterf1bB9EJ57 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mterf1bB9EJ57 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mterf1bB9EJ57 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mterf1bB9EJ57 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mterf1bB9EJ57 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mterf1bB9EJ57 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mterf1bB9EJ57 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mterf1bB9EJ57 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mterf1bB9EJ57 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mterf1bB9EJ57 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mterf1bB9EJ57 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mterf1bB9EJ57 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mterf1bB9EJ57 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mterf1bB9EJ57 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Mterf1bB9EJ57 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Mterf1bB9EJ57 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mterf1bB9EJ57 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mterf1bB9EJ57 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mterf1bB9EJ57 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mterf1bB9EJ57 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mterf1bB9EJ57 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mterf1bB9EJ57 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mterf1bB9EJ57 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mterf1bB9EJ57 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mterf1bB9EJ57 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mterf1bB9EJ57 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mterf1bB9EJ57 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mterf1bB9EJ57 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Mterf1bB9EJ57 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mterf1bB9EJ57 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mterf1bB9EJ57 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mterf1bB9EJ57 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mterf1bB9EJ57 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mterf1bB9EJ57 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mterf1bB9EJ57 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mterf1bB9EJ57 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mterf1bB9EJ57 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mterf1bB9EJ57 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mterf1bB9EJ57 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mterf1bB9EJ57 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mterf1bB9EJ57 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mterf1bB9EJ57 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mterf1bB9EJ57 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mterf1bB9EJ57 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mterf1bB9EJ57 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mterf1bB9EJ57 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mterf1bB9EJ57 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mterf1bB9EJ57 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mterf1bB9EJ57 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mterf1bB9EJ57 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mterf1bB9EJ57 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mterf1bB9EJ57 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mterf1bB9EJ57 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mterf1bB9EJ57 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mterf1bB9EJ57 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mterf1bB9EJ57 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mterf1bB9EJ57 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mterf1bB9EJ57 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mterf1bB9EJ57 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mterf1bB9EJ57 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mterf1bB9EJ57 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mterf1bB9EJ57 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mterf1bB9EJ57 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mterf1bB9EJ57 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mterf1bB9EJ57 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mterf1bB9EJ57 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mterf1bB9EJ57 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mterf1bB9EJ57 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mterf1bB9EJ57 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Mterf1bB9EJ57 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mterf1bB9EJ57 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mterf1bB9EJ57 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mterf1bB9EJ57 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mterf1bB9EJ57 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mterf1bB9EJ57 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mterf1bB9EJ57 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mterf1bB9EJ57 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mterf1bB9EJ57 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mterf1bB9EJ57 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mterf1bB9EJ57 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mterf1bB9EJ57 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mterf1bB9EJ57 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mterf1bB9EJ57 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mterf1bB9EJ57 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mterf1bB9EJ57 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mterf1bB9EJ57 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mterf1bB9EJ57 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mterf1bB9EJ57 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Mterf1bB9EJ57 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mterf1bB9EJ57 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mterf1bB9EJ57 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mterf1bB9EJ57 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mterf1bB9EJ57 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mterf1bB9EJ57 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms