Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Phf11cB4XVP9 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Phf11cB4XVP9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Phf11cB4XVP9 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Phf11cB4XVP9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Phf11cB4XVP9 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Phf11cB4XVP9 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Phf11cB4XVP9 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Phf11cB4XVP9 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Phf11cB4XVP9 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Phf11cB4XVP9 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Phf11cB4XVP9 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Phf11cB4XVP9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Phf11cB4XVP9 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Phf11cB4XVP9 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Phf11cB4XVP9 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Phf11cB4XVP9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Phf11cB4XVP9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Phf11cB4XVP9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Phf11cB4XVP9 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Phf11cB4XVP9 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Phf11cB4XVP9 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Phf11cB4XVP9 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Phf11cB4XVP9 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Phf11cB4XVP9 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Phf11cB4XVP9 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Phf11cB4XVP9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Phf11cB4XVP9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Phf11cB4XVP9 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Phf11cB4XVP9 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Phf11cB4XVP9 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Phf11cB4XVP9 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Phf11cB4XVP9 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Phf11cB4XVP9 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Phf11cB4XVP9 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Phf11cB4XVP9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Phf11cB4XVP9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Phf11cB4XVP9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Phf11cB4XVP9 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Phf11cB4XVP9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Phf11cB4XVP9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Phf11cB4XVP9 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Phf11cB4XVP9 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Phf11cB4XVP9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Phf11cB4XVP9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Phf11cB4XVP9 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Phf11cB4XVP9 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Phf11cB4XVP9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Phf11cB4XVP9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Phf11cB4XVP9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Phf11cB4XVP9 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Phf11cB4XVP9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Phf11cB4XVP9 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Phf11cB4XVP9 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Phf11cB4XVP9 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Phf11cB4XVP9 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Phf11cB4XVP9 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Phf11cB4XVP9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Phf11cB4XVP9 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Phf11cB4XVP9 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Phf11cB4XVP9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Phf11cB4XVP9 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Phf11cB4XVP9 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Phf11cB4XVP9 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Phf11cB4XVP9 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Phf11cB4XVP9 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Phf11cB4XVP9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Phf11cB4XVP9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Phf11cB4XVP9 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Phf11cB4XVP9 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Phf11cB4XVP9 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Phf11cB4XVP9 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Phf11cB4XVP9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Phf11cB4XVP9 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Phf11cB4XVP9 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Phf11cB4XVP9 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Phf11cB4XVP9 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Phf11cB4XVP9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Phf11cB4XVP9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Phf11cB4XVP9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Phf11cB4XVP9 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Phf11cB4XVP9 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Phf11cB4XVP9 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Phf11cB4XVP9 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Phf11cB4XVP9 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Phf11cB4XVP9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Phf11cB4XVP9 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Phf11cB4XVP9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Phf11cB4XVP9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Phf11cB4XVP9 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Phf11cB4XVP9 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Phf11cB4XVP9 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Phf11cB4XVP9 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Phf11cB4XVP9 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Phf11cB4XVP9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Phf11cB4XVP9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Phf11cB4XVP9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Phf11cB4XVP9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Phf11cB4XVP9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Phf11cB4XVP9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms