Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 Gm5650-201ENSMUST00000209641 598 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 AC134439.3-201ENSMUST00000223486 851 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 Nnmt-201ENSMUST00000034808 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Atg16l1Q8C0J2 Gm10053-201ENSMUST00000073080 949 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 Klk1b4-201ENSMUST00000077354 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 Krt78-201ENSMUST00000164932 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 Gabra5-203ENSMUST00000206734 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 Cilp-201ENSMUST00000048762 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 Cd14-201ENSMUST00000061829 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 Stard13-208ENSMUST00000202111 3373 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Atg16l1Q8C0J2 Gm29590-201ENSMUST00000190396 1304 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 Tstd2-201ENSMUST00000107770 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 2310065F04Rik-201ENSMUST00000125538 2724 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Atg16l1Q8C0J2 Gm44284-201ENSMUST00000203836 3444 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 Ppil2-201ENSMUST00000023455 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 Rufy4-201ENSMUST00000080167 2306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 Herc3-202ENSMUST00000041401 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Atg16l1Q8C0J2 CT010575.1-201ENSMUST00000220666 2924 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 Rufy3-202ENSMUST00000196686 2077 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 Cntln-203ENSMUST00000107190 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 AC117656.2-201ENSMUST00000224931 2215 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 Uspl1-206ENSMUST00000122160 3827 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 Ncbp3-201ENSMUST00000021135 12106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 R3hdm2-205ENSMUST00000105251 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Atg16l1Q8C0J2 Car13-201ENSMUST00000029071 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 Dytn-201ENSMUST00000090313 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 Pwp1-201ENSMUST00000001836 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Atg16l1Q8C0J2 AC138284.4-201ENSMUST00000216704 2882 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
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Atg16l1Q8C0J2 Tsr2-202ENSMUST00000112683 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Atg16l1Q8C0J2 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Atg16l1Q8C0J2 4930570G19Rik-201ENSMUST00000139363 3112 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 Nolc1-209ENSMUST00000225780 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 Prr16-201ENSMUST00000116639 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 Arhgap10-203ENSMUST00000210922 2208 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Atg16l1Q8C0J2 Txndc16-209ENSMUST00000153383 3691 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 Zfp446-201ENSMUST00000045810 4615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 Kif23-201ENSMUST00000034815 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 Myh4-202ENSMUST00000170942 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 Micalcl-202ENSMUST00000051308 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
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Atg16l1Q8C0J2 Dgkd-201ENSMUST00000027517 5695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atg16l1Q8C0J2 Uox-201ENSMUST00000029837 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atg16l1Q8C0J2 Gcc2-201ENSMUST00000057659 6547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atg16l1Q8C0J2 Atp7b-201ENSMUST00000006742 6505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atg16l1Q8C0J2 AC140393.1-201ENSMUST00000227959 1581 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Atg16l1Q8C0J2 Ttc16-205ENSMUST00000161089 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atg16l1Q8C0J2 Itpripl1-202ENSMUST00000132773 3424 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atg16l1Q8C0J2 Brd9-201ENSMUST00000099384 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atg16l1Q8C0J2 Gm13120-201ENSMUST00000117343 1446 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Atg16l1Q8C0J2 Gnpda2-206ENSMUST00000166298 1755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atg16l1Q8C0J2 Timeless-205ENSMUST00000105244 4341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atg16l1Q8C0J2 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
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Atg16l1Q8C0J2 Gm12733-201ENSMUST00000119871 767 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Atg16l1Q8C0J2 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms