Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z205

Rfxank, DNA-binding protein RFXANK, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfxankQ9Z205 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RfxankQ9Z205 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RfxankQ9Z205 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RfxankQ9Z205 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RfxankQ9Z205 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RfxankQ9Z205 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RfxankQ9Z205 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RfxankQ9Z205 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RfxankQ9Z205 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RfxankQ9Z205 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RfxankQ9Z205 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RfxankQ9Z205 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RfxankQ9Z205 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RfxankQ9Z205 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RfxankQ9Z205 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RfxankQ9Z205 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RfxankQ9Z205 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RfxankQ9Z205 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RfxankQ9Z205 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RfxankQ9Z205 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RfxankQ9Z205 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RfxankQ9Z205 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RfxankQ9Z205 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RfxankQ9Z205 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RfxankQ9Z205 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RfxankQ9Z205 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RfxankQ9Z205 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RfxankQ9Z205 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RfxankQ9Z205 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RfxankQ9Z205 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RfxankQ9Z205 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RfxankQ9Z205 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RfxankQ9Z205 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RfxankQ9Z205 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RfxankQ9Z205 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RfxankQ9Z205 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RfxankQ9Z205 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RfxankQ9Z205 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RfxankQ9Z205 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RfxankQ9Z205 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RfxankQ9Z205 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RfxankQ9Z205 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RfxankQ9Z205 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RfxankQ9Z205 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RfxankQ9Z205 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RfxankQ9Z205 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RfxankQ9Z205 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RfxankQ9Z205 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RfxankQ9Z205 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RfxankQ9Z205 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RfxankQ9Z205 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RfxankQ9Z205 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RfxankQ9Z205 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RfxankQ9Z205 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RfxankQ9Z205 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RfxankQ9Z205 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RfxankQ9Z205 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RfxankQ9Z205 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RfxankQ9Z205 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RfxankQ9Z205 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RfxankQ9Z205 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RfxankQ9Z205 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RfxankQ9Z205 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RfxankQ9Z205 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RfxankQ9Z205 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RfxankQ9Z205 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RfxankQ9Z205 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RfxankQ9Z205 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RfxankQ9Z205 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RfxankQ9Z205 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RfxankQ9Z205 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RfxankQ9Z205 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RfxankQ9Z205 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RfxankQ9Z205 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RfxankQ9Z205 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RfxankQ9Z205 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RfxankQ9Z205 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RfxankQ9Z205 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RfxankQ9Z205 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RfxankQ9Z205 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RfxankQ9Z205 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RfxankQ9Z205 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RfxankQ9Z205 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RfxankQ9Z205 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RfxankQ9Z205 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RfxankQ9Z205 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RfxankQ9Z205 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RfxankQ9Z205 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RfxankQ9Z205 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RfxankQ9Z205 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RfxankQ9Z205 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RfxankQ9Z205 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RfxankQ9Z205 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RfxankQ9Z205 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RfxankQ9Z205 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RfxankQ9Z205 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RfxankQ9Z205 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RfxankQ9Z205 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RfxankQ9Z205 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RfxankQ9Z205 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms