Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU39

FOXD4L1, Forkhead box protein D4-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L1Q9NU39 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FOXD4L1Q9NU39 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
FOXD4L1Q9NU39 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FOXD4L1Q9NU39 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FOXD4L1Q9NU39 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FOXD4L1Q9NU39 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FOXD4L1Q9NU39 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FOXD4L1Q9NU39 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FOXD4L1Q9NU39 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
FOXD4L1Q9NU39 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FOXD4L1Q9NU39 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FOXD4L1Q9NU39 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FOXD4L1Q9NU39 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
FOXD4L1Q9NU39 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FOXD4L1Q9NU39 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FOXD4L1Q9NU39 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FOXD4L1Q9NU39 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FOXD4L1Q9NU39 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
FOXD4L1Q9NU39 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FOXD4L1Q9NU39 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FOXD4L1Q9NU39 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
FOXD4L1Q9NU39 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
FOXD4L1Q9NU39 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
FOXD4L1Q9NU39 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
FOXD4L1Q9NU39 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FOXD4L1Q9NU39 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
FOXD4L1Q9NU39 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
FOXD4L1Q9NU39 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
FOXD4L1Q9NU39 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FOXD4L1Q9NU39 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FOXD4L1Q9NU39 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FOXD4L1Q9NU39 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FOXD4L1Q9NU39 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
FOXD4L1Q9NU39 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FOXD4L1Q9NU39 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FOXD4L1Q9NU39 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FOXD4L1Q9NU39 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FOXD4L1Q9NU39 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FOXD4L1Q9NU39 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FOXD4L1Q9NU39 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FOXD4L1Q9NU39 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FOXD4L1Q9NU39 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FOXD4L1Q9NU39 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FOXD4L1Q9NU39 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FOXD4L1Q9NU39 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FOXD4L1Q9NU39 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FOXD4L1Q9NU39 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FOXD4L1Q9NU39 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FOXD4L1Q9NU39 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FOXD4L1Q9NU39 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FOXD4L1Q9NU39 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FOXD4L1Q9NU39 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
FOXD4L1Q9NU39 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FOXD4L1Q9NU39 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
FOXD4L1Q9NU39 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
FOXD4L1Q9NU39 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
FOXD4L1Q9NU39 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
FOXD4L1Q9NU39 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FOXD4L1Q9NU39 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
FOXD4L1Q9NU39 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FOXD4L1Q9NU39 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FOXD4L1Q9NU39 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FOXD4L1Q9NU39 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FOXD4L1Q9NU39 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FOXD4L1Q9NU39 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FOXD4L1Q9NU39 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
FOXD4L1Q9NU39 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FOXD4L1Q9NU39 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FOXD4L1Q9NU39 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FOXD4L1Q9NU39 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
FOXD4L1Q9NU39 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FOXD4L1Q9NU39 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FOXD4L1Q9NU39 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
FOXD4L1Q9NU39 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
FOXD4L1Q9NU39 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
FOXD4L1Q9NU39 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FOXD4L1Q9NU39 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FOXD4L1Q9NU39 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
FOXD4L1Q9NU39 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FOXD4L1Q9NU39 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FOXD4L1Q9NU39 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FOXD4L1Q9NU39 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FOXD4L1Q9NU39 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FOXD4L1Q9NU39 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FOXD4L1Q9NU39 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FOXD4L1Q9NU39 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FOXD4L1Q9NU39 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FOXD4L1Q9NU39 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FOXD4L1Q9NU39 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
FOXD4L1Q9NU39 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FOXD4L1Q9NU39 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FOXD4L1Q9NU39 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FOXD4L1Q9NU39 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FOXD4L1Q9NU39 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FOXD4L1Q9NU39 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FOXD4L1Q9NU39 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FOXD4L1Q9NU39 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
FOXD4L1Q9NU39 RGS1-203ENST00000469578 1034 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FOXD4L1Q9NU39 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FOXD4L1Q9NU39 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms